Protein–RNA interactions for Protein: P42357

HAL, Histidine ammonia-lyase, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HALP42357 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HALP42357 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HALP42357 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HALP42357 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HALP42357 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HALP42357 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HALP42357 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HALP42357 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HALP42357 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HALP42357 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HALP42357 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HALP42357 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HALP42357 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HALP42357 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HALP42357 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HALP42357 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HALP42357 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HALP42357 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HALP42357 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HALP42357 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HALP42357 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HALP42357 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
HALP42357 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HALP42357 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HALP42357 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HALP42357 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
HALP42357 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HALP42357 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HALP42357 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HALP42357 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HALP42357 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HALP42357 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HALP42357 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HALP42357 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HALP42357 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HALP42357 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HALP42357 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HALP42357 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HALP42357 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HALP42357 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HALP42357 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HALP42357 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HALP42357 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HALP42357 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HALP42357 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HALP42357 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HALP42357 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HALP42357 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HALP42357 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HALP42357 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HALP42357 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HALP42357 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HALP42357 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HALP42357 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HALP42357 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HALP42357 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HALP42357 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HALP42357 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HALP42357 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HALP42357 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
HALP42357 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HALP42357 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HALP42357 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HALP42357 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HALP42357 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HALP42357 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HALP42357 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HALP42357 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HALP42357 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HALP42357 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HALP42357 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HALP42357 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HALP42357 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HALP42357 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HALP42357 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HALP42357 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HALP42357 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HALP42357 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HALP42357 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HALP42357 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HALP42357 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
HALP42357 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HALP42357 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HALP42357 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
HALP42357 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HALP42357 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HALP42357 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HALP42357 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HALP42357 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HALP42357 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HALP42357 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HALP42357 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HALP42357 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HALP42357 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HALP42357 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HALP42357 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HALP42357 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HALP42357 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HALP42357 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HALP42357 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms