Protein–RNA interactions for Protein: P41226

UBA7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA7P41226 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
UBA7P41226 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
UBA7P41226 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
UBA7P41226 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
UBA7P41226 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
UBA7P41226 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
UBA7P41226 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
UBA7P41226 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
UBA7P41226 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
UBA7P41226 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
UBA7P41226 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
UBA7P41226 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
UBA7P41226 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
UBA7P41226 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
UBA7P41226 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
UBA7P41226 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
UBA7P41226 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
UBA7P41226 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
UBA7P41226 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
UBA7P41226 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
UBA7P41226 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
UBA7P41226 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
UBA7P41226 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
UBA7P41226 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
UBA7P41226 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
UBA7P41226 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
UBA7P41226 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
UBA7P41226 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
UBA7P41226 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
UBA7P41226 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
UBA7P41226 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
UBA7P41226 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
UBA7P41226 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
UBA7P41226 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
UBA7P41226 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
UBA7P41226 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
UBA7P41226 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
UBA7P41226 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
UBA7P41226 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
UBA7P41226 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
UBA7P41226 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
UBA7P41226 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
UBA7P41226 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
UBA7P41226 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
UBA7P41226 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
UBA7P41226 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
UBA7P41226 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
UBA7P41226 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
UBA7P41226 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
UBA7P41226 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
UBA7P41226 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
UBA7P41226 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
UBA7P41226 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
UBA7P41226 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
UBA7P41226 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
UBA7P41226 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
UBA7P41226 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
UBA7P41226 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
UBA7P41226 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
UBA7P41226 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
UBA7P41226 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
UBA7P41226 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
UBA7P41226 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
UBA7P41226 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
UBA7P41226 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
UBA7P41226 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
UBA7P41226 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
UBA7P41226 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
UBA7P41226 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
UBA7P41226 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
UBA7P41226 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
UBA7P41226 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
UBA7P41226 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
UBA7P41226 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
UBA7P41226 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
UBA7P41226 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
UBA7P41226 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29■■■□□ 2.23
UBA7P41226 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
UBA7P41226 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
UBA7P41226 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
UBA7P41226 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
UBA7P41226 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
UBA7P41226 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
UBA7P41226 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
UBA7P41226 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
UBA7P41226 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
UBA7P41226 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
UBA7P41226 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
UBA7P41226 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
UBA7P41226 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
UBA7P41226 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
UBA7P41226 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
UBA7P41226 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
UBA7P41226 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
UBA7P41226 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
UBA7P41226 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
UBA7P41226 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
UBA7P41226 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
UBA7P41226 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
UBA7P41226 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms