Protein–RNA interactions for Protein: P41222

PTGDS, Prostaglandin-H2 D-isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDSP41222 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTGDSP41222 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTGDSP41222 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PTGDSP41222 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTGDSP41222 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTGDSP41222 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTGDSP41222 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTGDSP41222 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTGDSP41222 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTGDSP41222 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTGDSP41222 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTGDSP41222 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTGDSP41222 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTGDSP41222 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTGDSP41222 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTGDSP41222 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTGDSP41222 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTGDSP41222 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTGDSP41222 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTGDSP41222 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PTGDSP41222 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTGDSP41222 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTGDSP41222 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PTGDSP41222 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTGDSP41222 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTGDSP41222 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTGDSP41222 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTGDSP41222 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTGDSP41222 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTGDSP41222 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTGDSP41222 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTGDSP41222 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTGDSP41222 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTGDSP41222 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTGDSP41222 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTGDSP41222 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTGDSP41222 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTGDSP41222 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTGDSP41222 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTGDSP41222 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTGDSP41222 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTGDSP41222 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTGDSP41222 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTGDSP41222 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTGDSP41222 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTGDSP41222 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTGDSP41222 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTGDSP41222 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PTGDSP41222 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTGDSP41222 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTGDSP41222 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTGDSP41222 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTGDSP41222 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTGDSP41222 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTGDSP41222 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTGDSP41222 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTGDSP41222 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PTGDSP41222 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTGDSP41222 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTGDSP41222 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTGDSP41222 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PTGDSP41222 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTGDSP41222 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTGDSP41222 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTGDSP41222 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTGDSP41222 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PTGDSP41222 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTGDSP41222 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTGDSP41222 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTGDSP41222 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PTGDSP41222 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTGDSP41222 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTGDSP41222 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGDSP41222 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGDSP41222 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGDSP41222 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGDSP41222 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGDSP41222 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGDSP41222 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGDSP41222 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTGDSP41222 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTGDSP41222 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTGDSP41222 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTGDSP41222 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTGDSP41222 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTGDSP41222 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTGDSP41222 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTGDSP41222 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTGDSP41222 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PTGDSP41222 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGDSP41222 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGDSP41222 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTGDSP41222 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTGDSP41222 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTGDSP41222 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTGDSP41222 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGDSP41222 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGDSP41222 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGDSP41222 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGDSP41222 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms