Protein–RNA interactions for Protein: P40617

ARL4A, ADP-ribosylation factor-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4AP40617 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARL4AP40617 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARL4AP40617 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARL4AP40617 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARL4AP40617 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARL4AP40617 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARL4AP40617 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ARL4AP40617 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ARL4AP40617 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ARL4AP40617 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARL4AP40617 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARL4AP40617 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARL4AP40617 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARL4AP40617 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARL4AP40617 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARL4AP40617 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARL4AP40617 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ARL4AP40617 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARL4AP40617 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARL4AP40617 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARL4AP40617 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARL4AP40617 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARL4AP40617 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARL4AP40617 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARL4AP40617 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARL4AP40617 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARL4AP40617 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARL4AP40617 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARL4AP40617 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARL4AP40617 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ARL4AP40617 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARL4AP40617 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARL4AP40617 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARL4AP40617 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARL4AP40617 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARL4AP40617 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARL4AP40617 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARL4AP40617 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ARL4AP40617 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARL4AP40617 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARL4AP40617 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARL4AP40617 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARL4AP40617 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARL4AP40617 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
ARL4AP40617 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARL4AP40617 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
ARL4AP40617 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARL4AP40617 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARL4AP40617 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARL4AP40617 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARL4AP40617 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARL4AP40617 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARL4AP40617 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARL4AP40617 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARL4AP40617 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARL4AP40617 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARL4AP40617 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARL4AP40617 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARL4AP40617 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARL4AP40617 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARL4AP40617 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARL4AP40617 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ARL4AP40617 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ARL4AP40617 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARL4AP40617 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARL4AP40617 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARL4AP40617 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARL4AP40617 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARL4AP40617 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARL4AP40617 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARL4AP40617 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ARL4AP40617 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ARL4AP40617 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ARL4AP40617 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ARL4AP40617 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARL4AP40617 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ARL4AP40617 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARL4AP40617 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARL4AP40617 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARL4AP40617 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARL4AP40617 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARL4AP40617 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARL4AP40617 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARL4AP40617 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ARL4AP40617 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARL4AP40617 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARL4AP40617 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARL4AP40617 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARL4AP40617 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARL4AP40617 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARL4AP40617 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARL4AP40617 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARL4AP40617 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARL4AP40617 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARL4AP40617 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARL4AP40617 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARL4AP40617 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARL4AP40617 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARL4AP40617 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARL4AP40617 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms