Protein–RNA interactions for Protein: P40198

CEACAM3, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM3P40198 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CEACAM3P40198 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CEACAM3P40198 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CEACAM3P40198 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CEACAM3P40198 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CEACAM3P40198 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CEACAM3P40198 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CEACAM3P40198 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CEACAM3P40198 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CEACAM3P40198 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CEACAM3P40198 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CEACAM3P40198 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CEACAM3P40198 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CEACAM3P40198 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CEACAM3P40198 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CEACAM3P40198 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CEACAM3P40198 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CEACAM3P40198 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CEACAM3P40198 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CEACAM3P40198 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CEACAM3P40198 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CEACAM3P40198 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CEACAM3P40198 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CEACAM3P40198 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CEACAM3P40198 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CEACAM3P40198 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CEACAM3P40198 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CEACAM3P40198 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CEACAM3P40198 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CEACAM3P40198 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CEACAM3P40198 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CEACAM3P40198 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CEACAM3P40198 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CEACAM3P40198 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CEACAM3P40198 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CEACAM3P40198 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CEACAM3P40198 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CEACAM3P40198 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CEACAM3P40198 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CEACAM3P40198 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CEACAM3P40198 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CEACAM3P40198 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CEACAM3P40198 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CEACAM3P40198 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CEACAM3P40198 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CEACAM3P40198 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CEACAM3P40198 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CEACAM3P40198 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CEACAM3P40198 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CEACAM3P40198 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CEACAM3P40198 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CEACAM3P40198 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CEACAM3P40198 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CEACAM3P40198 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CEACAM3P40198 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CEACAM3P40198 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CEACAM3P40198 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CEACAM3P40198 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CEACAM3P40198 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CEACAM3P40198 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CEACAM3P40198 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CEACAM3P40198 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CEACAM3P40198 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CEACAM3P40198 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CEACAM3P40198 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CEACAM3P40198 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CEACAM3P40198 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CEACAM3P40198 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CEACAM3P40198 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CEACAM3P40198 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CEACAM3P40198 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CEACAM3P40198 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CEACAM3P40198 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CEACAM3P40198 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CEACAM3P40198 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CEACAM3P40198 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CEACAM3P40198 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CEACAM3P40198 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CEACAM3P40198 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CEACAM3P40198 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CEACAM3P40198 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CEACAM3P40198 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CEACAM3P40198 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CEACAM3P40198 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CEACAM3P40198 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CEACAM3P40198 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CEACAM3P40198 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CEACAM3P40198 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CEACAM3P40198 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CEACAM3P40198 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CEACAM3P40198 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CEACAM3P40198 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CEACAM3P40198 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CEACAM3P40198 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CEACAM3P40198 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CEACAM3P40198 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CEACAM3P40198 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CEACAM3P40198 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CEACAM3P40198 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CEACAM3P40198 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms