Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ACTN2P35609 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ACTN2P35609 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ACTN2P35609 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ACTN2P35609 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ACTN2P35609 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ACTN2P35609 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ACTN2P35609 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ACTN2P35609 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ACTN2P35609 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ACTN2P35609 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ACTN2P35609 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ACTN2P35609 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ACTN2P35609 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ACTN2P35609 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ACTN2P35609 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ACTN2P35609 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ACTN2P35609 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ACTN2P35609 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ACTN2P35609 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ACTN2P35609 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ACTN2P35609 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ACTN2P35609 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ACTN2P35609 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ACTN2P35609 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ACTN2P35609 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ACTN2P35609 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ACTN2P35609 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ACTN2P35609 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ACTN2P35609 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ACTN2P35609 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ACTN2P35609 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ACTN2P35609 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ACTN2P35609 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ACTN2P35609 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ACTN2P35609 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ACTN2P35609 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ACTN2P35609 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ACTN2P35609 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ACTN2P35609 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ACTN2P35609 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ACTN2P35609 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ACTN2P35609 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ACTN2P35609 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ACTN2P35609 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ACTN2P35609 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ACTN2P35609 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ACTN2P35609 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ACTN2P35609 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ACTN2P35609 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ACTN2P35609 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ACTN2P35609 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ACTN2P35609 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ACTN2P35609 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ACTN2P35609 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ACTN2P35609 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ACTN2P35609 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ACTN2P35609 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ACTN2P35609 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ACTN2P35609 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ACTN2P35609 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ACTN2P35609 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ACTN2P35609 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ACTN2P35609 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ACTN2P35609 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ACTN2P35609 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ACTN2P35609 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ACTN2P35609 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ACTN2P35609 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ACTN2P35609 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ACTN2P35609 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ACTN2P35609 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ACTN2P35609 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ACTN2P35609 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ACTN2P35609 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ACTN2P35609 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ACTN2P35609 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ACTN2P35609 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ACTN2P35609 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ACTN2P35609 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ACTN2P35609 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ACTN2P35609 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ACTN2P35609 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ACTN2P35609 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ACTN2P35609 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ACTN2P35609 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ACTN2P35609 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ACTN2P35609 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ACTN2P35609 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ACTN2P35609 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ACTN2P35609 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ACTN2P35609 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ACTN2P35609 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ACTN2P35609 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ACTN2P35609 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ACTN2P35609 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ACTN2P35609 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ACTN2P35609 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ACTN2P35609 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ACTN2P35609 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms