Protein–RNA interactions for Protein: P33947

KDELR2, ER lumen protein-retaining receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR2P33947 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDELR2P33947 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDELR2P33947 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDELR2P33947 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDELR2P33947 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDELR2P33947 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDELR2P33947 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDELR2P33947 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDELR2P33947 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDELR2P33947 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDELR2P33947 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDELR2P33947 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDELR2P33947 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDELR2P33947 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDELR2P33947 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KDELR2P33947 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDELR2P33947 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDELR2P33947 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KDELR2P33947 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDELR2P33947 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDELR2P33947 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDELR2P33947 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDELR2P33947 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDELR2P33947 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDELR2P33947 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDELR2P33947 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDELR2P33947 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDELR2P33947 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDELR2P33947 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDELR2P33947 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDELR2P33947 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDELR2P33947 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDELR2P33947 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDELR2P33947 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDELR2P33947 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDELR2P33947 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDELR2P33947 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDELR2P33947 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDELR2P33947 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KDELR2P33947 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDELR2P33947 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDELR2P33947 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDELR2P33947 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDELR2P33947 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDELR2P33947 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDELR2P33947 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDELR2P33947 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KDELR2P33947 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDELR2P33947 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDELR2P33947 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDELR2P33947 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KDELR2P33947 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDELR2P33947 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDELR2P33947 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDELR2P33947 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KDELR2P33947 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDELR2P33947 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDELR2P33947 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDELR2P33947 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDELR2P33947 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDELR2P33947 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDELR2P33947 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDELR2P33947 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDELR2P33947 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDELR2P33947 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDELR2P33947 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDELR2P33947 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDELR2P33947 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDELR2P33947 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDELR2P33947 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDELR2P33947 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDELR2P33947 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDELR2P33947 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDELR2P33947 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDELR2P33947 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDELR2P33947 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDELR2P33947 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDELR2P33947 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KDELR2P33947 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDELR2P33947 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDELR2P33947 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDELR2P33947 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDELR2P33947 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDELR2P33947 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDELR2P33947 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDELR2P33947 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KDELR2P33947 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDELR2P33947 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDELR2P33947 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDELR2P33947 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDELR2P33947 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDELR2P33947 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDELR2P33947 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KDELR2P33947 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KDELR2P33947 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KDELR2P33947 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KDELR2P33947 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KDELR2P33947 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDELR2P33947 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDELR2P33947 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms