Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCKBRP32239 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCKBRP32239 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCKBRP32239 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCKBRP32239 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCKBRP32239 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCKBRP32239 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCKBRP32239 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCKBRP32239 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCKBRP32239 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCKBRP32239 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCKBRP32239 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCKBRP32239 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCKBRP32239 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCKBRP32239 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCKBRP32239 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCKBRP32239 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCKBRP32239 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCKBRP32239 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCKBRP32239 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCKBRP32239 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCKBRP32239 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCKBRP32239 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCKBRP32239 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCKBRP32239 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCKBRP32239 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCKBRP32239 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCKBRP32239 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCKBRP32239 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCKBRP32239 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CCKBRP32239 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCKBRP32239 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCKBRP32239 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCKBRP32239 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCKBRP32239 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCKBRP32239 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCKBRP32239 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCKBRP32239 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCKBRP32239 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCKBRP32239 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCKBRP32239 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCKBRP32239 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCKBRP32239 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCKBRP32239 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCKBRP32239 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCKBRP32239 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCKBRP32239 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCKBRP32239 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCKBRP32239 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCKBRP32239 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCKBRP32239 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCKBRP32239 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCKBRP32239 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCKBRP32239 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCKBRP32239 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCKBRP32239 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCKBRP32239 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCKBRP32239 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCKBRP32239 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CCKBRP32239 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCKBRP32239 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCKBRP32239 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCKBRP32239 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCKBRP32239 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCKBRP32239 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCKBRP32239 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCKBRP32239 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCKBRP32239 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCKBRP32239 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCKBRP32239 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCKBRP32239 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCKBRP32239 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCKBRP32239 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCKBRP32239 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCKBRP32239 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCKBRP32239 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCKBRP32239 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCKBRP32239 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCKBRP32239 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCKBRP32239 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCKBRP32239 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCKBRP32239 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCKBRP32239 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCKBRP32239 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCKBRP32239 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCKBRP32239 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCKBRP32239 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCKBRP32239 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCKBRP32239 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCKBRP32239 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CCKBRP32239 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCKBRP32239 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CCKBRP32239 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCKBRP32239 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCKBRP32239 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCKBRP32239 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCKBRP32239 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCKBRP32239 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCKBRP32239 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCKBRP32239 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms