Protein–RNA interactions for Protein: P32004

L1CAM, Neural cell adhesion molecule L1, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1CAMP32004 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
L1CAMP32004 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
L1CAMP32004 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
L1CAMP32004 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
L1CAMP32004 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
L1CAMP32004 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
L1CAMP32004 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
L1CAMP32004 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
L1CAMP32004 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
L1CAMP32004 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
L1CAMP32004 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
L1CAMP32004 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
L1CAMP32004 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
L1CAMP32004 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
L1CAMP32004 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
L1CAMP32004 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
L1CAMP32004 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
L1CAMP32004 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
L1CAMP32004 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
L1CAMP32004 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
L1CAMP32004 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
L1CAMP32004 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
L1CAMP32004 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
L1CAMP32004 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
L1CAMP32004 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
L1CAMP32004 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
L1CAMP32004 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
L1CAMP32004 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
L1CAMP32004 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
L1CAMP32004 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
L1CAMP32004 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
L1CAMP32004 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
L1CAMP32004 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
L1CAMP32004 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
L1CAMP32004 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
L1CAMP32004 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
L1CAMP32004 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
L1CAMP32004 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
L1CAMP32004 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
L1CAMP32004 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
L1CAMP32004 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
L1CAMP32004 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
L1CAMP32004 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
L1CAMP32004 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
L1CAMP32004 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
L1CAMP32004 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
L1CAMP32004 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
L1CAMP32004 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
L1CAMP32004 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
L1CAMP32004 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
L1CAMP32004 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
L1CAMP32004 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
L1CAMP32004 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
L1CAMP32004 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
L1CAMP32004 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
L1CAMP32004 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
L1CAMP32004 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
L1CAMP32004 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
L1CAMP32004 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
L1CAMP32004 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
L1CAMP32004 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
L1CAMP32004 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
L1CAMP32004 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
L1CAMP32004 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
L1CAMP32004 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
L1CAMP32004 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
L1CAMP32004 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
L1CAMP32004 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
L1CAMP32004 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
L1CAMP32004 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
L1CAMP32004 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
L1CAMP32004 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
L1CAMP32004 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
L1CAMP32004 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
L1CAMP32004 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
L1CAMP32004 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
L1CAMP32004 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
L1CAMP32004 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
L1CAMP32004 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
L1CAMP32004 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
L1CAMP32004 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
L1CAMP32004 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
L1CAMP32004 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
L1CAMP32004 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
L1CAMP32004 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
L1CAMP32004 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
L1CAMP32004 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
L1CAMP32004 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
L1CAMP32004 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
L1CAMP32004 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
L1CAMP32004 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
L1CAMP32004 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
L1CAMP32004 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
L1CAMP32004 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
L1CAMP32004 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
L1CAMP32004 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
L1CAMP32004 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
L1CAMP32004 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
L1CAMP32004 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
L1CAMP32004 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms