Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXC12P31275 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXC12P31275 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXC12P31275 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXC12P31275 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXC12P31275 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXC12P31275 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXC12P31275 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXC12P31275 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXC12P31275 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXC12P31275 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXC12P31275 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXC12P31275 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXC12P31275 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HOXC12P31275 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXC12P31275 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXC12P31275 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXC12P31275 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXC12P31275 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXC12P31275 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXC12P31275 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXC12P31275 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXC12P31275 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXC12P31275 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXC12P31275 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXC12P31275 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXC12P31275 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXC12P31275 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXC12P31275 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC12P31275 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC12P31275 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXC12P31275 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC12P31275 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC12P31275 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC12P31275 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC12P31275 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXC12P31275 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXC12P31275 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC12P31275 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC12P31275 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC12P31275 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC12P31275 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC12P31275 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC12P31275 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC12P31275 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC12P31275 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC12P31275 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC12P31275 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC12P31275 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC12P31275 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC12P31275 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC12P31275 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC12P31275 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC12P31275 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC12P31275 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC12P31275 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXC12P31275 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC12P31275 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC12P31275 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC12P31275 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC12P31275 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC12P31275 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC12P31275 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC12P31275 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXC12P31275 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXC12P31275 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXC12P31275 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXC12P31275 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXC12P31275 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXC12P31275 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXC12P31275 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXC12P31275 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXC12P31275 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXC12P31275 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXC12P31275 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXC12P31275 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HOXC12P31275 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HOXC12P31275 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXC12P31275 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXC12P31275 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXC12P31275 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXC12P31275 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXC12P31275 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXC12P31275 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXC12P31275 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXC12P31275 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXC12P31275 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXC12P31275 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXC12P31275 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXC12P31275 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXC12P31275 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXC12P31275 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXC12P31275 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXC12P31275 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXC12P31275 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXC12P31275 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXC12P31275 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HOXC12P31275 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXC12P31275 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXC12P31275 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms