Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMB5P28074 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMB5P28074 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSMB5P28074 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSMB5P28074 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSMB5P28074 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSMB5P28074 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSMB5P28074 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSMB5P28074 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSMB5P28074 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSMB5P28074 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSMB5P28074 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMB5P28074 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMB5P28074 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMB5P28074 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMB5P28074 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMB5P28074 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMB5P28074 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMB5P28074 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMB5P28074 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMB5P28074 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMB5P28074 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMB5P28074 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMB5P28074 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMB5P28074 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMB5P28074 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMB5P28074 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMB5P28074 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMB5P28074 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMB5P28074 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMB5P28074 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMB5P28074 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMB5P28074 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMB5P28074 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMB5P28074 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMB5P28074 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMB5P28074 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMB5P28074 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMB5P28074 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMB5P28074 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMB5P28074 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMB5P28074 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMB5P28074 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMB5P28074 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSMB5P28074 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSMB5P28074 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PSMB5P28074 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSMB5P28074 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSMB5P28074 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSMB5P28074 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSMB5P28074 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PSMB5P28074 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSMB5P28074 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSMB5P28074 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSMB5P28074 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PSMB5P28074 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMB5P28074 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMB5P28074 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMB5P28074 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMB5P28074 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMB5P28074 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSMB5P28074 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSMB5P28074 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSMB5P28074 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSMB5P28074 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSMB5P28074 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PSMB5P28074 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PSMB5P28074 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSMB5P28074 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMB5P28074 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMB5P28074 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMB5P28074 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMB5P28074 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMB5P28074 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSMB5P28074 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSMB5P28074 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMB5P28074 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMB5P28074 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSMB5P28074 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMB5P28074 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMB5P28074 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMB5P28074 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMB5P28074 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMB5P28074 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PSMB5P28074 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PSMB5P28074 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSMB5P28074 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSMB5P28074 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSMB5P28074 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMB5P28074 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMB5P28074 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSMB5P28074 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSMB5P28074 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSMB5P28074 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSMB5P28074 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMB5P28074 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMB5P28074 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMB5P28074 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMB5P28074 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMB5P28074 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms