Protein–RNA interactions for Protein: P26196

DDX6, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX6, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX6P26196 CHTF18-208ENST00000471202 4494 ntTSL 214.02□□□□□ -0.177e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 REPIN1-211ENST00000486714 824 ntTSL 513.95□□□□□ -0.182e-6■■■■■ 53.3
DDX6P26196 ARHGEF17-205ENST00000543530 970 ntTSL 213.91□□□□□ -0.187e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 NAA10-205ENST00000393712 908 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.237e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.247e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 PHF20-201ENST00000339089 1997 ntTSL 213.46□□□□□ -0.257e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.267e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.266e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 CHTF18-201ENST00000262315 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.37e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 PHF20-211ENST00000481202 1635 ntTSL 1 (best)13.17□□□□□ -0.37e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.317e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 PISD-211ENST00000460723 2534 ntTSL 1 (best)13.12□□□□□ -0.317e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.317e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 NFE2L1-208ENST00000579537 372 ntTSL 413.05□□□□□ -0.327e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 DDX27-204ENST00000484427 4929 ntTSL 1 (best)13.04□□□□□ -0.327e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 ARID1B-211ENST00000635928 1551 ntTSL 512.98□□□□□ -0.337e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 PISD-203ENST00000397500 2194 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.357e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 NAA50-203ENST00000477813 1945 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.357e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 PHF20-208ENST00000461405 550 ntTSL 212.75□□□□□ -0.377e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 DDX27-206ENST00000618172 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.387e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 PHF20-203ENST00000374012 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.387e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 TBX3-201ENST00000257566 4208 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.417e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 UBN1-202ENST00000396658 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.427e-11■■■■■ 53.3
DDX6P26196 PGD-205ENST00000483936 680 ntTSL 512.35□□□□□ -0.437e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 PHF20-202ENST00000374000 1814 ntTSL 1 (best)12.33□□□□□ -0.447e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.447e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 MRPL45P2-201ENST00000425159 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.457e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 MID1IP1-204ENST00000614558 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.451e-8■■■■■ 53.3
DDX6P26196 AC009005.1-202ENST00000588908 625 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.467e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 DDX27-201ENST00000371764 2643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.477e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 ABL2-207ENST00000507173 3177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.487e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 PISD-202ENST00000382151 2669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.497e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 ABL2-202ENST00000367623 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.497e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 ZNF148-205ENST00000484491 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.58e-13■■■■■ 53.3
DDX6P26196 EHBP1L1-202ENST00000526990 3169 nt11.91□□□□□ -0.55e-8■■■■■ 53.3
DDX6P26196 ZNF148-206ENST00000485866 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.58e-13■■■■■ 53.3
DDX6P26196 PISD-204ENST00000422020 1015 ntTSL 511.9□□□□□ -0.57e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 ABL2-210ENST00000511413 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.517e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 CLDN4-203ENST00000435050 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.517e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 PISD-208ENST00000437808 2264 ntTSL 511.88□□□□□ -0.517e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 AC009005.1-203ENST00000590292 509 ntTSL 211.86□□□□□ -0.517e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 PGD-208ENST00000493288 476 ntTSL 311.85□□□□□ -0.517e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 SFPQ-201ENST00000357214 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.537e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 IDS-201ENST00000340855 7619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.537e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 IFNLR1-201ENST00000327535 4549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.562e-6■■■■■ 53.3
DDX6P26196 PISD-207ENST00000435900 1723 ntTSL 511.45□□□□□ -0.587e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 ABL2-211ENST00000512653 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.637e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 FAM107B-221ENST00000487335 2317 ntTSL 1 (best)11.11□□□□□ -0.637e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 CLDN4-202ENST00000431918 4108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.647e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 IDS-207ENST00000490775 945 ntTSL 310.8□□□□□ -0.687e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 AC244197.3-202ENST00000441880 416 ntTSL 210.76□□□□□ -0.697e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 DDX27-207ENST00000622530 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.727e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 PISD-201ENST00000266095 2655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.727e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 NAA50-210ENST00000616174 3257 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.787e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 NTN4-204ENST00000547980 749 ntTSL 310.09□□□□□ -0.797e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 PKD1-203ENST00000423118 14135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.82e-8■■■■■ 53.3
DDX6P26196 ARHGEF11-206ENST00000487682 4796 ntTSL 210.07□□□□□ -0.87e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 PKD1-201ENST00000262304 14138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.82e-8■■■■■ 53.3
DDX6P26196 NTN4-202ENST00000344911 3152 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.837e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 E2F3-202ENST00000535432 4425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.857e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 ARHGEF11-202ENST00000368194 6889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.877e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 ZNF148-207ENST00000492394 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.888e-13■■■■■ 53.3
DDX6P26196 FAM107B-206ENST00000378470 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.937e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 ABL2-206ENST00000504405 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.947e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 OAZ2-202ENST00000558194 7102 ntTSL 28.79□□□□□ -17e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 STXBP6-204ENST00000546511 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.017e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 FAM107B-201ENST00000181796 3785 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.037e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 MRPL45P2-204ENST00000575291 1765 ntTSL 1 (best)8.2□□□□□ -1.17e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 SFPQ-202ENST00000460428 464 ntTSL 28.18□□□□□ -1.17e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 MRPL45P2-202ENST00000572695 804 ntTSL 37.96□□□□□ -1.147e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 DDX27-203ENST00000471144 3639 ntTSL 1 (best)7.81□□□□□ -1.167e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 IDS-204ENST00000464251 959 ntTSL 57.7□□□□□ -1.187e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 UBN1-208ENST00000590769 3530 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.197e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 ZNF148-201ENST00000360647 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.268e-13■■■■■ 53.3
DDX6P26196 ABL2-201ENST00000344730 6910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.277e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 STXBP6-205ENST00000548182 3355 ntTSL 26.72□□□□□ -1.337e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 IDS-205ENST00000466019 537 ntTSL 26.3□□□□□ -1.47e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 RAPGEF2-206ENST00000505478 838 ntTSL 54.63□□□□□ -1.677e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.727e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 SFPQ-206ENST00000470472 874 ntTSL 54.13□□□□□ -1.757e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 MED4-204ENST00000495013 460 ntTSL 33.83□□□□□ -1.87e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 SPP1-203ENST00000395080 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.415e-10■■■■■ 53.2
DDX6P26196 SPP1-211ENST00000614857 1558 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.715e-10■■■■■ 53.2
DDX6P26196 SPP1-201ENST00000237623 1581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.995e-10■■■■■ 53.2
DDX6P26196 SPP1-202ENST00000360804 1196 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.35e-10■■■■■ 53.2
DDX6P26196 SPP1-209ENST00000509659 1664 ntTSL 1 (best)6.68□□□□□ -1.345e-10■■■■■ 53.2
DDX6P26196 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.613e-38■■■■■ 52.8
DDX6P26196 EMD-207ENST00000486738 1284 ntTSL 318.57■□□□□ 0.563e-38■■■■■ 52.8
DDX6P26196 EMD-203ENST00000428228 946 ntTSL 318.37■□□□□ 0.533e-38■■■■■ 52.8
DDX6P26196 EMD-208ENST00000492448 832 ntTSL 217.82■□□□□ 0.443e-38■■■■■ 52.8
DDX6P26196 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.742e-6■■■■■ 52.6
DDX6P26196 NR1H2-205ENST00000595730 713 ntTSL 218.34■□□□□ 0.532e-6■■■■■ 52.6
DDX6P26196 NR1H2-207ENST00000597130 894 ntTSL 317.45■□□□□ 0.382e-6■■■■■ 52.6
DDX6P26196 NR1H2-209ENST00000597790 718 ntTSL 217.11■□□□□ 0.332e-6■■■■■ 52.6
DDX6P26196 NR1H2-212ENST00000600355 507 ntTSL 315.39■□□□□ 0.052e-6■■■■■ 52.6
DDX6P26196 RTEL1-207ENST00000463361 575 ntTSL 414.21□□□□□ -0.139e-9■■■■■ 52.6
DDX6P26196 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.23e-6■■■■■ 52.2
DDX6P26196 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.013e-6■■■■■ 52.2
DDX6P26196 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.955e-6■■■■■ 52.2
DDX6P26196 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.135e-6■■■■■ 52.2
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