Protein–RNA interactions for Protein: P25025

CXCR2, C-X-C chemokine receptor type 2, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR2P25025 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CXCR2P25025 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CXCR2P25025 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CXCR2P25025 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CXCR2P25025 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CXCR2P25025 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CXCR2P25025 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CXCR2P25025 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CXCR2P25025 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CXCR2P25025 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CXCR2P25025 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CXCR2P25025 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CXCR2P25025 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CXCR2P25025 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CXCR2P25025 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CXCR2P25025 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CXCR2P25025 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CXCR2P25025 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CXCR2P25025 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CXCR2P25025 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CXCR2P25025 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CXCR2P25025 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CXCR2P25025 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CXCR2P25025 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CXCR2P25025 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CXCR2P25025 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CXCR2P25025 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CXCR2P25025 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CXCR2P25025 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CXCR2P25025 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CXCR2P25025 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CXCR2P25025 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CXCR2P25025 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CXCR2P25025 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CXCR2P25025 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CXCR2P25025 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CXCR2P25025 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CXCR2P25025 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CXCR2P25025 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CXCR2P25025 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CXCR2P25025 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CXCR2P25025 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CXCR2P25025 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CXCR2P25025 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CXCR2P25025 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CXCR2P25025 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CXCR2P25025 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CXCR2P25025 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CXCR2P25025 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CXCR2P25025 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CXCR2P25025 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CXCR2P25025 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CXCR2P25025 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CXCR2P25025 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CXCR2P25025 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CXCR2P25025 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CXCR2P25025 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CXCR2P25025 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CXCR2P25025 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CXCR2P25025 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CXCR2P25025 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CXCR2P25025 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CXCR2P25025 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CXCR2P25025 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CXCR2P25025 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CXCR2P25025 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CXCR2P25025 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CXCR2P25025 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CXCR2P25025 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CXCR2P25025 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CXCR2P25025 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CXCR2P25025 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CXCR2P25025 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CXCR2P25025 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CXCR2P25025 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CXCR2P25025 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CXCR2P25025 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CXCR2P25025 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CXCR2P25025 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CXCR2P25025 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CXCR2P25025 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CXCR2P25025 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CXCR2P25025 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CXCR2P25025 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CXCR2P25025 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CXCR2P25025 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CXCR2P25025 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CXCR2P25025 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CXCR2P25025 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CXCR2P25025 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CXCR2P25025 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CXCR2P25025 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CXCR2P25025 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CXCR2P25025 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CXCR2P25025 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CXCR2P25025 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CXCR2P25025 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CXCR2P25025 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CXCR2P25025 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CXCR2P25025 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms