Protein–RNA interactions for Protein: P24347

MMP11, Stromelysin-3, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP11P24347 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MMP11P24347 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MMP11P24347 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MMP11P24347 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MMP11P24347 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MMP11P24347 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MMP11P24347 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MMP11P24347 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MMP11P24347 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MMP11P24347 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MMP11P24347 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MMP11P24347 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MMP11P24347 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
MMP11P24347 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MMP11P24347 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MMP11P24347 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MMP11P24347 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MMP11P24347 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP11P24347 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP11P24347 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP11P24347 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP11P24347 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP11P24347 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMP11P24347 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMP11P24347 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMP11P24347 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMP11P24347 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MMP11P24347 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MMP11P24347 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MMP11P24347 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MMP11P24347 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MMP11P24347 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MMP11P24347 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MMP11P24347 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MMP11P24347 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MMP11P24347 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MMP11P24347 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MMP11P24347 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MMP11P24347 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MMP11P24347 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MMP11P24347 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MMP11P24347 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MMP11P24347 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MMP11P24347 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MMP11P24347 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MMP11P24347 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MMP11P24347 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MMP11P24347 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MMP11P24347 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MMP11P24347 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MMP11P24347 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MMP11P24347 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MMP11P24347 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MMP11P24347 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MMP11P24347 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MMP11P24347 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MMP11P24347 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MMP11P24347 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MMP11P24347 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP11P24347 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP11P24347 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP11P24347 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP11P24347 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP11P24347 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP11P24347 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MMP11P24347 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MMP11P24347 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MMP11P24347 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MMP11P24347 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MMP11P24347 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MMP11P24347 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MMP11P24347 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MMP11P24347 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MMP11P24347 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MMP11P24347 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MMP11P24347 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MMP11P24347 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MMP11P24347 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MMP11P24347 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MMP11P24347 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MMP11P24347 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MMP11P24347 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MMP11P24347 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MMP11P24347 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MMP11P24347 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MMP11P24347 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP11P24347 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP11P24347 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP11P24347 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP11P24347 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP11P24347 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP11P24347 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP11P24347 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP11P24347 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP11P24347 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP11P24347 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP11P24347 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP11P24347 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MMP11P24347 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MMP11P24347 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.6 ms