Protein–RNA interactions for Protein: P23368

ME2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME2P23368 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ME2P23368 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ME2P23368 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ME2P23368 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ME2P23368 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ME2P23368 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ME2P23368 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ME2P23368 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ME2P23368 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ME2P23368 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ME2P23368 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ME2P23368 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ME2P23368 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ME2P23368 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ME2P23368 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ME2P23368 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ME2P23368 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ME2P23368 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ME2P23368 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ME2P23368 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ME2P23368 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ME2P23368 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ME2P23368 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ME2P23368 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ME2P23368 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ME2P23368 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ME2P23368 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ME2P23368 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ME2P23368 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ME2P23368 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ME2P23368 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ME2P23368 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ME2P23368 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ME2P23368 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ME2P23368 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ME2P23368 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ME2P23368 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ME2P23368 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ME2P23368 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ME2P23368 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ME2P23368 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ME2P23368 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ME2P23368 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ME2P23368 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ME2P23368 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ME2P23368 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ME2P23368 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ME2P23368 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ME2P23368 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ME2P23368 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ME2P23368 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ME2P23368 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ME2P23368 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ME2P23368 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ME2P23368 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ME2P23368 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ME2P23368 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ME2P23368 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ME2P23368 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ME2P23368 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ME2P23368 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ME2P23368 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ME2P23368 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ME2P23368 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ME2P23368 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ME2P23368 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ME2P23368 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ME2P23368 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ME2P23368 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ME2P23368 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ME2P23368 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ME2P23368 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ME2P23368 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ME2P23368 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ME2P23368 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ME2P23368 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ME2P23368 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ME2P23368 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ME2P23368 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ME2P23368 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ME2P23368 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ME2P23368 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ME2P23368 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ME2P23368 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ME2P23368 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ME2P23368 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ME2P23368 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ME2P23368 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ME2P23368 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ME2P23368 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ME2P23368 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ME2P23368 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ME2P23368 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ME2P23368 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ME2P23368 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ME2P23368 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ME2P23368 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ME2P23368 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ME2P23368 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ME2P23368 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms