Protein–RNA interactions for Protein: P23258

TUBG1, Tubulin gamma-1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBG1P23258 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBG1P23258 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBG1P23258 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBG1P23258 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBG1P23258 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBG1P23258 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBG1P23258 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBG1P23258 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBG1P23258 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBG1P23258 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBG1P23258 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBG1P23258 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBG1P23258 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBG1P23258 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBG1P23258 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBG1P23258 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBG1P23258 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBG1P23258 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBG1P23258 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBG1P23258 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBG1P23258 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBG1P23258 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBG1P23258 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBG1P23258 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBG1P23258 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBG1P23258 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBG1P23258 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBG1P23258 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBG1P23258 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBG1P23258 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBG1P23258 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBG1P23258 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBG1P23258 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBG1P23258 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TUBG1P23258 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBG1P23258 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBG1P23258 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBG1P23258 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBG1P23258 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBG1P23258 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBG1P23258 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBG1P23258 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBG1P23258 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBG1P23258 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBG1P23258 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBG1P23258 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBG1P23258 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBG1P23258 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBG1P23258 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBG1P23258 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBG1P23258 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBG1P23258 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBG1P23258 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBG1P23258 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBG1P23258 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBG1P23258 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBG1P23258 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBG1P23258 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBG1P23258 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBG1P23258 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBG1P23258 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBG1P23258 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBG1P23258 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBG1P23258 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBG1P23258 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBG1P23258 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBG1P23258 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBG1P23258 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBG1P23258 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBG1P23258 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBG1P23258 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBG1P23258 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBG1P23258 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBG1P23258 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBG1P23258 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBG1P23258 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBG1P23258 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBG1P23258 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBG1P23258 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBG1P23258 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBG1P23258 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBG1P23258 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBG1P23258 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBG1P23258 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBG1P23258 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBG1P23258 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBG1P23258 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBG1P23258 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBG1P23258 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBG1P23258 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBG1P23258 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBG1P23258 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBG1P23258 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBG1P23258 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBG1P23258 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBG1P23258 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBG1P23258 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBG1P23258 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBG1P23258 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBG1P23258 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms