Protein–RNA interactions for Protein: P19793

RXRA, Retinoic acid receptor RXR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRAP19793 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
RXRAP19793 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
RXRAP19793 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
RXRAP19793 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
RXRAP19793 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
RXRAP19793 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RXRAP19793 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RXRAP19793 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RXRAP19793 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RXRAP19793 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RXRAP19793 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
RXRAP19793 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
RXRAP19793 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RXRAP19793 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
RXRAP19793 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
RXRAP19793 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RXRAP19793 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
RXRAP19793 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
RXRAP19793 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RXRAP19793 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RXRAP19793 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RXRAP19793 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RXRAP19793 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RXRAP19793 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
RXRAP19793 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RXRAP19793 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RXRAP19793 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RXRAP19793 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
RXRAP19793 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RXRAP19793 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RXRAP19793 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
RXRAP19793 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RXRAP19793 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
RXRAP19793 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
RXRAP19793 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RXRAP19793 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RXRAP19793 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RXRAP19793 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RXRAP19793 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RXRAP19793 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RXRAP19793 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RXRAP19793 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RXRAP19793 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RXRAP19793 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RXRAP19793 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RXRAP19793 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RXRAP19793 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
RXRAP19793 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RXRAP19793 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
RXRAP19793 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
RXRAP19793 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
RXRAP19793 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
RXRAP19793 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
RXRAP19793 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
RXRAP19793 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RXRAP19793 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
RXRAP19793 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RXRAP19793 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RXRAP19793 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RXRAP19793 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RXRAP19793 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RXRAP19793 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RXRAP19793 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RXRAP19793 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RXRAP19793 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RXRAP19793 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RXRAP19793 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RXRAP19793 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RXRAP19793 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RXRAP19793 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RXRAP19793 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RXRAP19793 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RXRAP19793 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RXRAP19793 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RXRAP19793 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RXRAP19793 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RXRAP19793 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RXRAP19793 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
RXRAP19793 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
RXRAP19793 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
RXRAP19793 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
RXRAP19793 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RXRAP19793 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RXRAP19793 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RXRAP19793 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RXRAP19793 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RXRAP19793 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
RXRAP19793 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RXRAP19793 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RXRAP19793 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RXRAP19793 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RXRAP19793 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
RXRAP19793 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
RXRAP19793 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
RXRAP19793 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
RXRAP19793 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RXRAP19793 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30.13■■■□□ 2.41
RXRAP19793 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
RXRAP19793 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RXRAP19793 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms