Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NCLP19338 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NCLP19338 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
NCLP19338 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NCLP19338 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
NCLP19338 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NCLP19338 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NCLP19338 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NCLP19338 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NCLP19338 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NCLP19338 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NCLP19338 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NCLP19338 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NCLP19338 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NCLP19338 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NCLP19338 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NCLP19338 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NCLP19338 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NCLP19338 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
NCLP19338 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NCLP19338 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
NCLP19338 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
NCLP19338 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
NCLP19338 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NCLP19338 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NCLP19338 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NCLP19338 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
NCLP19338 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
NCLP19338 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
NCLP19338 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
NCLP19338 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
NCLP19338 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
NCLP19338 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NCLP19338 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NCLP19338 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NCLP19338 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NCLP19338 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NCLP19338 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NCLP19338 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NCLP19338 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NCLP19338 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NCLP19338 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NCLP19338 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NCLP19338 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NCLP19338 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NCLP19338 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NCLP19338 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
NCLP19338 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NCLP19338 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NCLP19338 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
NCLP19338 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
NCLP19338 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NCLP19338 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NCLP19338 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NCLP19338 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NCLP19338 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NCLP19338 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NCLP19338 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NCLP19338 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NCLP19338 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NCLP19338 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NCLP19338 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NCLP19338 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
NCLP19338 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NCLP19338 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NCLP19338 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NCLP19338 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NCLP19338 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NCLP19338 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NCLP19338 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NCLP19338 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NCLP19338 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NCLP19338 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NCLP19338 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NCLP19338 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NCLP19338 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NCLP19338 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NCLP19338 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NCLP19338 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NCLP19338 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NCLP19338 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NCLP19338 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NCLP19338 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NCLP19338 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NCLP19338 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NCLP19338 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NCLP19338 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NCLP19338 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NCLP19338 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NCLP19338 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NCLP19338 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NCLP19338 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NCLP19338 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NCLP19338 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NCLP19338 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NCLP19338 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NCLP19338 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NCLP19338 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NCLP19338 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NCLP19338 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms