Protein–RNA interactions for Protein: P17612

PRKACA, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACAP17612 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKACAP17612 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKACAP17612 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKACAP17612 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKACAP17612 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKACAP17612 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKACAP17612 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRKACAP17612 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKACAP17612 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKACAP17612 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKACAP17612 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKACAP17612 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKACAP17612 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKACAP17612 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKACAP17612 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKACAP17612 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKACAP17612 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKACAP17612 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKACAP17612 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKACAP17612 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKACAP17612 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKACAP17612 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKACAP17612 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKACAP17612 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKACAP17612 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKACAP17612 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKACAP17612 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKACAP17612 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKACAP17612 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKACAP17612 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKACAP17612 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKACAP17612 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKACAP17612 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKACAP17612 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKACAP17612 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKACAP17612 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKACAP17612 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKACAP17612 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKACAP17612 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKACAP17612 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKACAP17612 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKACAP17612 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKACAP17612 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKACAP17612 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKACAP17612 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKACAP17612 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKACAP17612 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKACAP17612 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKACAP17612 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKACAP17612 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKACAP17612 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKACAP17612 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKACAP17612 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKACAP17612 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKACAP17612 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKACAP17612 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKACAP17612 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKACAP17612 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKACAP17612 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKACAP17612 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKACAP17612 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKACAP17612 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKACAP17612 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKACAP17612 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PRKACAP17612 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKACAP17612 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKACAP17612 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKACAP17612 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKACAP17612 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKACAP17612 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKACAP17612 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKACAP17612 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKACAP17612 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKACAP17612 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKACAP17612 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKACAP17612 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKACAP17612 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKACAP17612 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKACAP17612 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKACAP17612 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKACAP17612 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKACAP17612 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKACAP17612 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKACAP17612 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKACAP17612 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKACAP17612 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKACAP17612 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKACAP17612 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKACAP17612 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PRKACAP17612 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKACAP17612 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKACAP17612 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKACAP17612 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRKACAP17612 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRKACAP17612 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRKACAP17612 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRKACAP17612 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PRKACAP17612 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PRKACAP17612 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRKACAP17612 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms