Protein–RNA interactions for Protein: P17301

ITGA2, Integrin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA2P17301 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGA2P17301 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGA2P17301 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGA2P17301 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGA2P17301 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGA2P17301 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGA2P17301 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGA2P17301 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGA2P17301 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ITGA2P17301 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGA2P17301 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGA2P17301 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGA2P17301 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGA2P17301 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGA2P17301 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGA2P17301 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA2P17301 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA2P17301 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA2P17301 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA2P17301 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA2P17301 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA2P17301 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA2P17301 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA2P17301 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA2P17301 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA2P17301 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA2P17301 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA2P17301 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA2P17301 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGA2P17301 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGA2P17301 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGA2P17301 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGA2P17301 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGA2P17301 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGA2P17301 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGA2P17301 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGA2P17301 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGA2P17301 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGA2P17301 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGA2P17301 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ITGA2P17301 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ITGA2P17301 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ITGA2P17301 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGA2P17301 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGA2P17301 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGA2P17301 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA2P17301 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA2P17301 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA2P17301 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA2P17301 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA2P17301 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA2P17301 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGA2P17301 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGA2P17301 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGA2P17301 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGA2P17301 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGA2P17301 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGA2P17301 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGA2P17301 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGA2P17301 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGA2P17301 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGA2P17301 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGA2P17301 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA2P17301 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA2P17301 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA2P17301 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA2P17301 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA2P17301 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGA2P17301 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGA2P17301 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGA2P17301 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGA2P17301 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGA2P17301 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGA2P17301 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGA2P17301 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGA2P17301 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGA2P17301 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA2P17301 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA2P17301 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA2P17301 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA2P17301 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA2P17301 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA2P17301 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA2P17301 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA2P17301 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA2P17301 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA2P17301 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA2P17301 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGA2P17301 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGA2P17301 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGA2P17301 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGA2P17301 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGA2P17301 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGA2P17301 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGA2P17301 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGA2P17301 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGA2P17301 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGA2P17301 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGA2P17301 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGA2P17301 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 358.4 ms