Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
ITGB4P16144 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ITGB4P16144 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ITGB4P16144 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
ITGB4P16144 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ITGB4P16144 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ITGB4P16144 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ITGB4P16144 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
ITGB4P16144 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
ITGB4P16144 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
ITGB4P16144 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ITGB4P16144 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ITGB4P16144 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ITGB4P16144 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ITGB4P16144 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC34.15■■■■□ 3.06
ITGB4P16144 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ITGB4P16144 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ITGB4P16144 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
ITGB4P16144 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
ITGB4P16144 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
ITGB4P16144 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ITGB4P16144 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ITGB4P16144 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
ITGB4P16144 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
ITGB4P16144 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
ITGB4P16144 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ITGB4P16144 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ITGB4P16144 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
ITGB4P16144 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
ITGB4P16144 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ITGB4P16144 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
ITGB4P16144 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
ITGB4P16144 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
ITGB4P16144 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
ITGB4P16144 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
ITGB4P16144 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
ITGB4P16144 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
ITGB4P16144 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ITGB4P16144 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ITGB4P16144 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ITGB4P16144 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ITGB4P16144 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
ITGB4P16144 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ITGB4P16144 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC34.02■■■■□ 3.04
ITGB4P16144 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
ITGB4P16144 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
ITGB4P16144 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ITGB4P16144 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ITGB4P16144 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ITGB4P16144 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
ITGB4P16144 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
ITGB4P16144 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC33.97■■■■□ 3.03
ITGB4P16144 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ITGB4P16144 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
ITGB4P16144 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ITGB4P16144 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
ITGB4P16144 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ITGB4P16144 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
ITGB4P16144 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
ITGB4P16144 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ITGB4P16144 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ITGB4P16144 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ITGB4P16144 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
ITGB4P16144 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
ITGB4P16144 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
ITGB4P16144 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ITGB4P16144 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
ITGB4P16144 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ITGB4P16144 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
ITGB4P16144 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
ITGB4P16144 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ITGB4P16144 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
ITGB4P16144 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ITGB4P16144 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ITGB4P16144 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
ITGB4P16144 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
ITGB4P16144 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ITGB4P16144 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
ITGB4P16144 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
ITGB4P16144 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
ITGB4P16144 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC33.81■■■■□ 3
ITGB4P16144 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ITGB4P16144 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ITGB4P16144 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ITGB4P16144 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ITGB4P16144 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
ITGB4P16144 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
ITGB4P16144 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ITGB4P16144 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ITGB4P16144 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ITGB4P16144 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ITGB4P16144 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ITGB4P16144 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
ITGB4P16144 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■■□ 3
ITGB4P16144 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
ITGB4P16144 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
ITGB4P16144 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
ITGB4P16144 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
ITGB4P16144 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
ITGB4P16144 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms