Protein–RNA interactions for Protein: P16070

CD44, CD44 antigen, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD44P16070 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CD44P16070 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CD44P16070 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CD44P16070 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CD44P16070 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CD44P16070 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CD44P16070 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CD44P16070 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CD44P16070 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CD44P16070 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CD44P16070 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CD44P16070 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CD44P16070 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CD44P16070 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CD44P16070 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CD44P16070 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CD44P16070 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CD44P16070 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CD44P16070 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CD44P16070 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CD44P16070 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CD44P16070 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CD44P16070 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CD44P16070 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CD44P16070 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CD44P16070 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CD44P16070 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CD44P16070 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CD44P16070 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CD44P16070 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CD44P16070 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CD44P16070 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CD44P16070 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CD44P16070 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CD44P16070 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CD44P16070 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CD44P16070 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CD44P16070 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CD44P16070 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CD44P16070 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CD44P16070 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CD44P16070 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CD44P16070 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CD44P16070 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CD44P16070 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CD44P16070 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CD44P16070 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CD44P16070 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CD44P16070 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CD44P16070 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CD44P16070 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CD44P16070 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CD44P16070 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CD44P16070 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CD44P16070 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CD44P16070 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CD44P16070 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CD44P16070 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CD44P16070 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CD44P16070 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CD44P16070 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CD44P16070 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CD44P16070 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CD44P16070 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CD44P16070 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CD44P16070 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CD44P16070 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CD44P16070 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CD44P16070 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CD44P16070 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CD44P16070 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CD44P16070 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CD44P16070 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CD44P16070 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CD44P16070 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CD44P16070 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CD44P16070 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CD44P16070 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CD44P16070 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CD44P16070 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CD44P16070 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CD44P16070 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CD44P16070 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CD44P16070 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CD44P16070 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CD44P16070 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CD44P16070 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CD44P16070 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CD44P16070 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CD44P16070 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CD44P16070 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CD44P16070 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CD44P16070 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CD44P16070 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CD44P16070 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CD44P16070 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CD44P16070 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CD44P16070 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CD44P16070 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CD44P16070 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms