Protein–RNA interactions for Protein: P15514

AREG, Amphiregulin, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AREGP15514 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
AREGP15514 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
AREGP15514 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
AREGP15514 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
AREGP15514 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
AREGP15514 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
AREGP15514 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
AREGP15514 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
AREGP15514 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
AREGP15514 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
AREGP15514 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
AREGP15514 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
AREGP15514 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
AREGP15514 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
AREGP15514 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
AREGP15514 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
AREGP15514 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
AREGP15514 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
AREGP15514 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
AREGP15514 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
AREGP15514 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
AREGP15514 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
AREGP15514 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
AREGP15514 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
AREGP15514 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
AREGP15514 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
AREGP15514 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
AREGP15514 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
AREGP15514 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AREGP15514 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
AREGP15514 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
AREGP15514 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
AREGP15514 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
AREGP15514 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AREGP15514 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AREGP15514 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AREGP15514 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
AREGP15514 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
AREGP15514 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AREGP15514 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AREGP15514 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
AREGP15514 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AREGP15514 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
AREGP15514 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
AREGP15514 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
AREGP15514 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AREGP15514 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AREGP15514 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AREGP15514 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AREGP15514 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AREGP15514 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
AREGP15514 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AREGP15514 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
AREGP15514 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
AREGP15514 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
AREGP15514 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
AREGP15514 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
AREGP15514 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
AREGP15514 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
AREGP15514 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AREGP15514 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AREGP15514 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
AREGP15514 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AREGP15514 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AREGP15514 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AREGP15514 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AREGP15514 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AREGP15514 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
AREGP15514 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
AREGP15514 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AREGP15514 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AREGP15514 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AREGP15514 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AREGP15514 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AREGP15514 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AREGP15514 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AREGP15514 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AREGP15514 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AREGP15514 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
AREGP15514 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AREGP15514 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AREGP15514 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AREGP15514 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AREGP15514 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AREGP15514 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AREGP15514 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AREGP15514 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AREGP15514 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AREGP15514 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AREGP15514 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AREGP15514 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AREGP15514 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AREGP15514 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AREGP15514 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AREGP15514 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AREGP15514 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AREGP15514 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AREGP15514 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AREGP15514 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AREGP15514 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms