Protein–RNA interactions for Protein: P14314

PRKCSH, Glucosidase 2 subunit beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCSHP14314 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PRKCSHP14314 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRKCSHP14314 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRKCSHP14314 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PRKCSHP14314 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PRKCSHP14314 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PRKCSHP14314 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PRKCSHP14314 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PRKCSHP14314 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PRKCSHP14314 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRKCSHP14314 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRKCSHP14314 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRKCSHP14314 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PRKCSHP14314 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PRKCSHP14314 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PRKCSHP14314 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PRKCSHP14314 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PRKCSHP14314 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PRKCSHP14314 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PRKCSHP14314 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRKCSHP14314 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
PRKCSHP14314 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
PRKCSHP14314 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PRKCSHP14314 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PRKCSHP14314 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PRKCSHP14314 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PRKCSHP14314 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PRKCSHP14314 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PRKCSHP14314 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PRKCSHP14314 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PRKCSHP14314 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PRKCSHP14314 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PRKCSHP14314 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PRKCSHP14314 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PRKCSHP14314 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PRKCSHP14314 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
PRKCSHP14314 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRKCSHP14314 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRKCSHP14314 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRKCSHP14314 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRKCSHP14314 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PRKCSHP14314 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PRKCSHP14314 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PRKCSHP14314 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PRKCSHP14314 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PRKCSHP14314 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PRKCSHP14314 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PRKCSHP14314 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PRKCSHP14314 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PRKCSHP14314 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PRKCSHP14314 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRKCSHP14314 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PRKCSHP14314 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PRKCSHP14314 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PRKCSHP14314 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PRKCSHP14314 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PRKCSHP14314 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PRKCSHP14314 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PRKCSHP14314 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PRKCSHP14314 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PRKCSHP14314 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PRKCSHP14314 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PRKCSHP14314 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PRKCSHP14314 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PRKCSHP14314 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PRKCSHP14314 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PRKCSHP14314 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PRKCSHP14314 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PRKCSHP14314 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PRKCSHP14314 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PRKCSHP14314 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PRKCSHP14314 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PRKCSHP14314 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PRKCSHP14314 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
PRKCSHP14314 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PRKCSHP14314 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PRKCSHP14314 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRKCSHP14314 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRKCSHP14314 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRKCSHP14314 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PRKCSHP14314 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PRKCSHP14314 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PRKCSHP14314 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PRKCSHP14314 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PRKCSHP14314 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRKCSHP14314 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRKCSHP14314 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRKCSHP14314 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PRKCSHP14314 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PRKCSHP14314 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PRKCSHP14314 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRKCSHP14314 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRKCSHP14314 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRKCSHP14314 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRKCSHP14314 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PRKCSHP14314 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRKCSHP14314 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRKCSHP14314 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRKCSHP14314 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRKCSHP14314 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms