Protein–RNA interactions for Protein: P13984

GTF2F2, General transcription factor IIF subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F2P13984 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2F2P13984 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2F2P13984 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2F2P13984 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2F2P13984 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2F2P13984 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2F2P13984 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2F2P13984 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2F2P13984 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2F2P13984 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2F2P13984 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2F2P13984 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2F2P13984 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2F2P13984 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2F2P13984 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2F2P13984 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2F2P13984 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2F2P13984 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2F2P13984 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2F2P13984 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2F2P13984 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2F2P13984 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2F2P13984 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2F2P13984 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2F2P13984 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2F2P13984 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2F2P13984 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2F2P13984 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2F2P13984 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2F2P13984 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2F2P13984 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2F2P13984 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2F2P13984 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2F2P13984 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2F2P13984 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2F2P13984 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2F2P13984 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2F2P13984 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2F2P13984 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2F2P13984 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2F2P13984 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2F2P13984 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2F2P13984 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2F2P13984 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2F2P13984 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2F2P13984 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2F2P13984 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2F2P13984 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2F2P13984 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2F2P13984 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2F2P13984 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2F2P13984 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2F2P13984 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2F2P13984 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2F2P13984 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2F2P13984 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2F2P13984 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2F2P13984 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2F2P13984 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2F2P13984 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2F2P13984 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2F2P13984 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2F2P13984 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2F2P13984 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2F2P13984 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2F2P13984 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2F2P13984 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2F2P13984 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2F2P13984 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2F2P13984 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2F2P13984 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2F2P13984 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2F2P13984 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2F2P13984 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2F2P13984 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2F2P13984 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2F2P13984 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2F2P13984 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2F2P13984 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2F2P13984 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2F2P13984 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2F2P13984 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2F2P13984 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2F2P13984 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2F2P13984 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2F2P13984 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2F2P13984 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2F2P13984 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2F2P13984 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2F2P13984 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2F2P13984 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2F2P13984 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2F2P13984 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2F2P13984 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2F2P13984 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2F2P13984 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2F2P13984 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2F2P13984 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2F2P13984 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2F2P13984 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms