Protein–RNA interactions for Protein: P13674

P4HA1, Prolyl 4-hydroxylase subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P4HA1P13674 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
P4HA1P13674 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
P4HA1P13674 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
P4HA1P13674 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
P4HA1P13674 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
P4HA1P13674 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
P4HA1P13674 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
P4HA1P13674 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
P4HA1P13674 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
P4HA1P13674 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
P4HA1P13674 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
P4HA1P13674 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
P4HA1P13674 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
P4HA1P13674 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
P4HA1P13674 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
P4HA1P13674 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
P4HA1P13674 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
P4HA1P13674 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
P4HA1P13674 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
P4HA1P13674 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
P4HA1P13674 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
P4HA1P13674 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
P4HA1P13674 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
P4HA1P13674 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
P4HA1P13674 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
P4HA1P13674 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
P4HA1P13674 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
P4HA1P13674 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
P4HA1P13674 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
P4HA1P13674 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
P4HA1P13674 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
P4HA1P13674 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
P4HA1P13674 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
P4HA1P13674 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
P4HA1P13674 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
P4HA1P13674 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
P4HA1P13674 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
P4HA1P13674 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
P4HA1P13674 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
P4HA1P13674 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
P4HA1P13674 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
P4HA1P13674 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
P4HA1P13674 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
P4HA1P13674 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
P4HA1P13674 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
P4HA1P13674 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
P4HA1P13674 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
P4HA1P13674 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
P4HA1P13674 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
P4HA1P13674 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
P4HA1P13674 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
P4HA1P13674 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
P4HA1P13674 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
P4HA1P13674 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
P4HA1P13674 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
P4HA1P13674 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
P4HA1P13674 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
P4HA1P13674 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
P4HA1P13674 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
P4HA1P13674 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
P4HA1P13674 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
P4HA1P13674 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
P4HA1P13674 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
P4HA1P13674 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
P4HA1P13674 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
P4HA1P13674 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
P4HA1P13674 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
P4HA1P13674 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
P4HA1P13674 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
P4HA1P13674 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
P4HA1P13674 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
P4HA1P13674 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
P4HA1P13674 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
P4HA1P13674 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
P4HA1P13674 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
P4HA1P13674 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
P4HA1P13674 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
P4HA1P13674 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
P4HA1P13674 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
P4HA1P13674 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
P4HA1P13674 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
P4HA1P13674 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
P4HA1P13674 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
P4HA1P13674 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
P4HA1P13674 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
P4HA1P13674 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
P4HA1P13674 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
P4HA1P13674 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
P4HA1P13674 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
P4HA1P13674 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
P4HA1P13674 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
P4HA1P13674 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
P4HA1P13674 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
P4HA1P13674 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
P4HA1P13674 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
P4HA1P13674 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
P4HA1P13674 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
P4HA1P13674 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
P4HA1P13674 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.56■■■□□ 2
P4HA1P13674 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 224.7 ms