Protein–RNA interactions for Protein: P12829

MYL4, Myosin light chain 4, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYL4P12829 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
MYL4P12829 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
MYL4P12829 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
MYL4P12829 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
MYL4P12829 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
MYL4P12829 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
MYL4P12829 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MYL4P12829 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MYL4P12829 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MYL4P12829 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MYL4P12829 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MYL4P12829 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MYL4P12829 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MYL4P12829 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MYL4P12829 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MYL4P12829 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MYL4P12829 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
MYL4P12829 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MYL4P12829 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MYL4P12829 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
MYL4P12829 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYL4P12829 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MYL4P12829 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MYL4P12829 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MYL4P12829 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MYL4P12829 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MYL4P12829 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MYL4P12829 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MYL4P12829 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MYL4P12829 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MYL4P12829 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MYL4P12829 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MYL4P12829 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MYL4P12829 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
MYL4P12829 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MYL4P12829 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MYL4P12829 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MYL4P12829 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MYL4P12829 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MYL4P12829 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MYL4P12829 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MYL4P12829 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
MYL4P12829 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MYL4P12829 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MYL4P12829 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MYL4P12829 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MYL4P12829 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MYL4P12829 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
MYL4P12829 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MYL4P12829 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MYL4P12829 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MYL4P12829 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MYL4P12829 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
MYL4P12829 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MYL4P12829 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MYL4P12829 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MYL4P12829 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MYL4P12829 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MYL4P12829 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MYL4P12829 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MYL4P12829 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MYL4P12829 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MYL4P12829 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MYL4P12829 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MYL4P12829 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MYL4P12829 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MYL4P12829 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MYL4P12829 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MYL4P12829 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MYL4P12829 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MYL4P12829 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MYL4P12829 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MYL4P12829 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MYL4P12829 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MYL4P12829 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MYL4P12829 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MYL4P12829 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MYL4P12829 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MYL4P12829 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MYL4P12829 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MYL4P12829 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MYL4P12829 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MYL4P12829 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MYL4P12829 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MYL4P12829 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MYL4P12829 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
MYL4P12829 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
MYL4P12829 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MYL4P12829 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MYL4P12829 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MYL4P12829 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MYL4P12829 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MYL4P12829 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MYL4P12829 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MYL4P12829 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MYL4P12829 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MYL4P12829 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MYL4P12829 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MYL4P12829 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MYL4P12829 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms