Protein–RNA interactions for Protein: P11908

PRPS2, Ribose-phosphate pyrophosphokinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPS2P11908 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPS2P11908 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPS2P11908 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPS2P11908 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPS2P11908 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPS2P11908 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPS2P11908 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPS2P11908 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPS2P11908 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPS2P11908 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPS2P11908 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPS2P11908 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPS2P11908 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPS2P11908 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPS2P11908 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPS2P11908 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPS2P11908 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPS2P11908 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPS2P11908 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPS2P11908 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPS2P11908 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPS2P11908 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPS2P11908 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPS2P11908 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPS2P11908 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPS2P11908 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPS2P11908 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPS2P11908 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPS2P11908 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPS2P11908 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPS2P11908 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPS2P11908 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPS2P11908 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPS2P11908 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPS2P11908 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPS2P11908 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPS2P11908 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPS2P11908 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPS2P11908 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPS2P11908 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPS2P11908 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPS2P11908 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPS2P11908 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPS2P11908 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPS2P11908 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPS2P11908 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPS2P11908 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPS2P11908 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRPS2P11908 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRPS2P11908 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRPS2P11908 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRPS2P11908 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRPS2P11908 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPS2P11908 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPS2P11908 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPS2P11908 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPS2P11908 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPS2P11908 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPS2P11908 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPS2P11908 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPS2P11908 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPS2P11908 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPS2P11908 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPS2P11908 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPS2P11908 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPS2P11908 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPS2P11908 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPS2P11908 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPS2P11908 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPS2P11908 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPS2P11908 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPS2P11908 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPS2P11908 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPS2P11908 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPS2P11908 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPS2P11908 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPS2P11908 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPS2P11908 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPS2P11908 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPS2P11908 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPS2P11908 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPS2P11908 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPS2P11908 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPS2P11908 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPS2P11908 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPS2P11908 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPS2P11908 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPS2P11908 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPS2P11908 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPS2P11908 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPS2P11908 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPS2P11908 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPS2P11908 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPS2P11908 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPS2P11908 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPS2P11908 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPS2P11908 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPS2P11908 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPS2P11908 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPS2P11908 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms