Protein–RNA interactions for Protein: P10643

C7, Complement component C7, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C7P10643 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
C7P10643 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
C7P10643 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
C7P10643 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
C7P10643 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
C7P10643 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
C7P10643 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
C7P10643 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
C7P10643 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
C7P10643 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
C7P10643 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
C7P10643 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
C7P10643 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
C7P10643 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
C7P10643 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
C7P10643 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
C7P10643 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
C7P10643 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
C7P10643 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
C7P10643 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
C7P10643 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
C7P10643 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
C7P10643 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
C7P10643 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
C7P10643 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
C7P10643 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
C7P10643 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
C7P10643 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
C7P10643 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
C7P10643 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
C7P10643 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
C7P10643 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
C7P10643 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
C7P10643 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
C7P10643 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
C7P10643 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
C7P10643 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
C7P10643 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
C7P10643 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
C7P10643 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
C7P10643 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
C7P10643 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
C7P10643 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
C7P10643 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
C7P10643 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
C7P10643 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
C7P10643 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
C7P10643 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
C7P10643 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
C7P10643 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
C7P10643 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
C7P10643 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
C7P10643 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
C7P10643 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
C7P10643 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
C7P10643 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
C7P10643 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
C7P10643 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
C7P10643 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
C7P10643 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C7P10643 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C7P10643 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C7P10643 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C7P10643 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C7P10643 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
C7P10643 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
C7P10643 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
C7P10643 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
C7P10643 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
C7P10643 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
C7P10643 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
C7P10643 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
C7P10643 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
C7P10643 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
C7P10643 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
C7P10643 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
C7P10643 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
C7P10643 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
C7P10643 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
C7P10643 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
C7P10643 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
C7P10643 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
C7P10643 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
C7P10643 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
C7P10643 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
C7P10643 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
C7P10643 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
C7P10643 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
C7P10643 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
C7P10643 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
C7P10643 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
C7P10643 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
C7P10643 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
C7P10643 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
C7P10643 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
C7P10643 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C7P10643 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
C7P10643 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C7P10643 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
C7P10643 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms