Protein–RNA interactions for Protein: P0DPA2

VSIG8, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG8P0DPA2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VSIG8P0DPA2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VSIG8P0DPA2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VSIG8P0DPA2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VSIG8P0DPA2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSIG8P0DPA2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSIG8P0DPA2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSIG8P0DPA2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSIG8P0DPA2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSIG8P0DPA2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSIG8P0DPA2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSIG8P0DPA2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSIG8P0DPA2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSIG8P0DPA2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSIG8P0DPA2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSIG8P0DPA2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSIG8P0DPA2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSIG8P0DPA2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSIG8P0DPA2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSIG8P0DPA2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSIG8P0DPA2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSIG8P0DPA2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSIG8P0DPA2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSIG8P0DPA2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSIG8P0DPA2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
VSIG8P0DPA2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VSIG8P0DPA2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSIG8P0DPA2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSIG8P0DPA2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSIG8P0DPA2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSIG8P0DPA2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSIG8P0DPA2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSIG8P0DPA2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSIG8P0DPA2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSIG8P0DPA2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSIG8P0DPA2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSIG8P0DPA2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSIG8P0DPA2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSIG8P0DPA2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSIG8P0DPA2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSIG8P0DPA2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSIG8P0DPA2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
VSIG8P0DPA2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSIG8P0DPA2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSIG8P0DPA2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VSIG8P0DPA2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VSIG8P0DPA2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VSIG8P0DPA2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VSIG8P0DPA2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VSIG8P0DPA2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VSIG8P0DPA2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VSIG8P0DPA2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VSIG8P0DPA2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VSIG8P0DPA2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VSIG8P0DPA2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VSIG8P0DPA2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VSIG8P0DPA2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VSIG8P0DPA2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VSIG8P0DPA2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VSIG8P0DPA2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VSIG8P0DPA2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VSIG8P0DPA2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VSIG8P0DPA2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VSIG8P0DPA2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VSIG8P0DPA2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VSIG8P0DPA2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VSIG8P0DPA2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VSIG8P0DPA2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VSIG8P0DPA2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
VSIG8P0DPA2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSIG8P0DPA2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VSIG8P0DPA2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSIG8P0DPA2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSIG8P0DPA2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSIG8P0DPA2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VSIG8P0DPA2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
VSIG8P0DPA2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VSIG8P0DPA2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VSIG8P0DPA2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VSIG8P0DPA2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VSIG8P0DPA2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VSIG8P0DPA2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VSIG8P0DPA2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VSIG8P0DPA2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VSIG8P0DPA2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VSIG8P0DPA2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
VSIG8P0DPA2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VSIG8P0DPA2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VSIG8P0DPA2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VSIG8P0DPA2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VSIG8P0DPA2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VSIG8P0DPA2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VSIG8P0DPA2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VSIG8P0DPA2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VSIG8P0DPA2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VSIG8P0DPA2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VSIG8P0DPA2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VSIG8P0DPA2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VSIG8P0DPA2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VSIG8P0DPA2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 183.5 ms