Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
RGPD2P0DJD1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
RGPD2P0DJD1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
RGPD2P0DJD1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
RGPD2P0DJD1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
RGPD2P0DJD1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
RGPD2P0DJD1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
RGPD2P0DJD1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
RGPD2P0DJD1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
RGPD2P0DJD1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
RGPD2P0DJD1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
RGPD2P0DJD1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
RGPD2P0DJD1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
RGPD2P0DJD1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
RGPD2P0DJD1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
RGPD2P0DJD1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
RGPD2P0DJD1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
RGPD2P0DJD1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
RGPD2P0DJD1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
RGPD2P0DJD1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
RGPD2P0DJD1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
RGPD2P0DJD1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
RGPD2P0DJD1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
RGPD2P0DJD1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC34.8■■■■□ 3.16
RGPD2P0DJD1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
RGPD2P0DJD1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
RGPD2P0DJD1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
RGPD2P0DJD1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
RGPD2P0DJD1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
RGPD2P0DJD1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
RGPD2P0DJD1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
RGPD2P0DJD1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
RGPD2P0DJD1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
RGPD2P0DJD1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
RGPD2P0DJD1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
RGPD2P0DJD1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
RGPD2P0DJD1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
RGPD2P0DJD1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
RGPD2P0DJD1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
RGPD2P0DJD1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
RGPD2P0DJD1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
RGPD2P0DJD1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
RGPD2P0DJD1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
RGPD2P0DJD1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
RGPD2P0DJD1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
RGPD2P0DJD1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
RGPD2P0DJD1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
RGPD2P0DJD1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
RGPD2P0DJD1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
RGPD2P0DJD1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC34.72■■■■□ 3.15
RGPD2P0DJD1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
RGPD2P0DJD1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
RGPD2P0DJD1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
RGPD2P0DJD1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
RGPD2P0DJD1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
RGPD2P0DJD1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
RGPD2P0DJD1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
RGPD2P0DJD1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
RGPD2P0DJD1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
RGPD2P0DJD1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
RGPD2P0DJD1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
RGPD2P0DJD1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
RGPD2P0DJD1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
RGPD2P0DJD1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
RGPD2P0DJD1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
RGPD2P0DJD1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
RGPD2P0DJD1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC34.59■■■■□ 3.13
RGPD2P0DJD1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
RGPD2P0DJD1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
RGPD2P0DJD1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
RGPD2P0DJD1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
RGPD2P0DJD1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
RGPD2P0DJD1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
RGPD2P0DJD1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
RGPD2P0DJD1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
RGPD2P0DJD1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
RGPD2P0DJD1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
RGPD2P0DJD1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
RGPD2P0DJD1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
RGPD2P0DJD1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
RGPD2P0DJD1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
RGPD2P0DJD1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
RGPD2P0DJD1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC34.51■■■■□ 3.11
RGPD2P0DJD1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
RGPD2P0DJD1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
RGPD2P0DJD1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
RGPD2P0DJD1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
RGPD2P0DJD1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
RGPD2P0DJD1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
RGPD2P0DJD1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
RGPD2P0DJD1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
RGPD2P0DJD1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
RGPD2P0DJD1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
RGPD2P0DJD1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
RGPD2P0DJD1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC34.47■■■■□ 3.11
RGPD2P0DJD1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
RGPD2P0DJD1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
RGPD2P0DJD1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC34.45■■■■□ 3.11
RGPD2P0DJD1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
RGPD2P0DJD1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms