Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC166P0CW27 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC166P0CW27 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC166P0CW27 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC166P0CW27 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC166P0CW27 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC166P0CW27 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC166P0CW27 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC166P0CW27 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC166P0CW27 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC166P0CW27 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC166P0CW27 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC166P0CW27 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC166P0CW27 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC166P0CW27 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC166P0CW27 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC166P0CW27 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC166P0CW27 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC166P0CW27 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC166P0CW27 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC166P0CW27 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC166P0CW27 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC166P0CW27 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC166P0CW27 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC166P0CW27 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC166P0CW27 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC166P0CW27 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC166P0CW27 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC166P0CW27 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC166P0CW27 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC166P0CW27 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC166P0CW27 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC166P0CW27 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC166P0CW27 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC166P0CW27 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC166P0CW27 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC166P0CW27 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC166P0CW27 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC166P0CW27 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC166P0CW27 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC166P0CW27 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC166P0CW27 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC166P0CW27 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC166P0CW27 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC166P0CW27 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC166P0CW27 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC166P0CW27 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC166P0CW27 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC166P0CW27 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC166P0CW27 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
CCDC166P0CW27 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC166P0CW27 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC166P0CW27 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC166P0CW27 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC166P0CW27 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC166P0CW27 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC166P0CW27 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC166P0CW27 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC166P0CW27 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC166P0CW27 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC166P0CW27 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC166P0CW27 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC166P0CW27 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC166P0CW27 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC166P0CW27 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC166P0CW27 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC166P0CW27 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC166P0CW27 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC166P0CW27 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC166P0CW27 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC166P0CW27 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC166P0CW27 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC166P0CW27 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC166P0CW27 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC166P0CW27 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC166P0CW27 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC166P0CW27 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC166P0CW27 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC166P0CW27 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC166P0CW27 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC166P0CW27 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC166P0CW27 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC166P0CW27 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC166P0CW27 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC166P0CW27 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC166P0CW27 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC166P0CW27 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC166P0CW27 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC166P0CW27 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC166P0CW27 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC166P0CW27 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC166P0CW27 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC166P0CW27 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC166P0CW27 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC166P0CW27 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC166P0CW27 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC166P0CW27 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC166P0CW27 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC166P0CW27 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC166P0CW27 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms