Protein–RNA interactions for Protein: P0CW18

PRSS56, Serine protease 56, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRSS56P0CW18 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PRSS56P0CW18 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRSS56P0CW18 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRSS56P0CW18 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRSS56P0CW18 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRSS56P0CW18 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PRSS56P0CW18 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRSS56P0CW18 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRSS56P0CW18 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRSS56P0CW18 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRSS56P0CW18 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PRSS56P0CW18 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRSS56P0CW18 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRSS56P0CW18 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRSS56P0CW18 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRSS56P0CW18 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRSS56P0CW18 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRSS56P0CW18 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRSS56P0CW18 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PRSS56P0CW18 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRSS56P0CW18 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRSS56P0CW18 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRSS56P0CW18 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PRSS56P0CW18 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRSS56P0CW18 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRSS56P0CW18 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRSS56P0CW18 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRSS56P0CW18 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRSS56P0CW18 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRSS56P0CW18 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRSS56P0CW18 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRSS56P0CW18 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRSS56P0CW18 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRSS56P0CW18 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRSS56P0CW18 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRSS56P0CW18 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRSS56P0CW18 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRSS56P0CW18 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRSS56P0CW18 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRSS56P0CW18 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRSS56P0CW18 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRSS56P0CW18 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRSS56P0CW18 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRSS56P0CW18 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRSS56P0CW18 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRSS56P0CW18 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRSS56P0CW18 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRSS56P0CW18 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PRSS56P0CW18 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRSS56P0CW18 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRSS56P0CW18 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRSS56P0CW18 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRSS56P0CW18 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRSS56P0CW18 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRSS56P0CW18 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRSS56P0CW18 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRSS56P0CW18 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRSS56P0CW18 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRSS56P0CW18 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRSS56P0CW18 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRSS56P0CW18 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRSS56P0CW18 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRSS56P0CW18 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRSS56P0CW18 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRSS56P0CW18 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRSS56P0CW18 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRSS56P0CW18 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRSS56P0CW18 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRSS56P0CW18 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRSS56P0CW18 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRSS56P0CW18 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRSS56P0CW18 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRSS56P0CW18 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRSS56P0CW18 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRSS56P0CW18 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRSS56P0CW18 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRSS56P0CW18 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRSS56P0CW18 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRSS56P0CW18 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRSS56P0CW18 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRSS56P0CW18 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRSS56P0CW18 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRSS56P0CW18 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRSS56P0CW18 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PRSS56P0CW18 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PRSS56P0CW18 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRSS56P0CW18 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRSS56P0CW18 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRSS56P0CW18 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRSS56P0CW18 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PRSS56P0CW18 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PRSS56P0CW18 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRSS56P0CW18 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRSS56P0CW18 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PRSS56P0CW18 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRSS56P0CW18 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRSS56P0CW18 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRSS56P0CW18 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PRSS56P0CW18 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRSS56P0CW18 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms