Protein–RNA interactions for Protein: P08908

HTR1A, 5-hydroxytryptamine receptor 1A, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1AP08908 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HTR1AP08908 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HTR1AP08908 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HTR1AP08908 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HTR1AP08908 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HTR1AP08908 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HTR1AP08908 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HTR1AP08908 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HTR1AP08908 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HTR1AP08908 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HTR1AP08908 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HTR1AP08908 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HTR1AP08908 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HTR1AP08908 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HTR1AP08908 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HTR1AP08908 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HTR1AP08908 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HTR1AP08908 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HTR1AP08908 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HTR1AP08908 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HTR1AP08908 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HTR1AP08908 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HTR1AP08908 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HTR1AP08908 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HTR1AP08908 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HTR1AP08908 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HTR1AP08908 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HTR1AP08908 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HTR1AP08908 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HTR1AP08908 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HTR1AP08908 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HTR1AP08908 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HTR1AP08908 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HTR1AP08908 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HTR1AP08908 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HTR1AP08908 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HTR1AP08908 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HTR1AP08908 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HTR1AP08908 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HTR1AP08908 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HTR1AP08908 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HTR1AP08908 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HTR1AP08908 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HTR1AP08908 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HTR1AP08908 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HTR1AP08908 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HTR1AP08908 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HTR1AP08908 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HTR1AP08908 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HTR1AP08908 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HTR1AP08908 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTR1AP08908 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTR1AP08908 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTR1AP08908 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTR1AP08908 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTR1AP08908 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTR1AP08908 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTR1AP08908 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTR1AP08908 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTR1AP08908 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTR1AP08908 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTR1AP08908 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTR1AP08908 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTR1AP08908 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HTR1AP08908 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HTR1AP08908 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HTR1AP08908 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTR1AP08908 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTR1AP08908 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTR1AP08908 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTR1AP08908 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HTR1AP08908 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HTR1AP08908 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HTR1AP08908 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HTR1AP08908 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HTR1AP08908 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HTR1AP08908 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTR1AP08908 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTR1AP08908 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTR1AP08908 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTR1AP08908 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTR1AP08908 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTR1AP08908 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTR1AP08908 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTR1AP08908 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTR1AP08908 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTR1AP08908 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTR1AP08908 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HTR1AP08908 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HTR1AP08908 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HTR1AP08908 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HTR1AP08908 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTR1AP08908 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTR1AP08908 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTR1AP08908 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTR1AP08908 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTR1AP08908 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTR1AP08908 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTR1AP08908 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTR1AP08908 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms