Protein–RNA interactions for Protein: P08572

COL4A2, Collagen alpha-2(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A2P08572 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
COL4A2P08572 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
COL4A2P08572 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
COL4A2P08572 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
COL4A2P08572 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
COL4A2P08572 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
COL4A2P08572 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
COL4A2P08572 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
COL4A2P08572 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
COL4A2P08572 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
COL4A2P08572 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
COL4A2P08572 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
COL4A2P08572 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
COL4A2P08572 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
COL4A2P08572 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
COL4A2P08572 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
COL4A2P08572 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
COL4A2P08572 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
COL4A2P08572 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
COL4A2P08572 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
COL4A2P08572 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
COL4A2P08572 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
COL4A2P08572 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
COL4A2P08572 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
COL4A2P08572 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL4A2P08572 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL4A2P08572 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL4A2P08572 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL4A2P08572 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL4A2P08572 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL4A2P08572 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL4A2P08572 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COL4A2P08572 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL4A2P08572 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL4A2P08572 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL4A2P08572 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
COL4A2P08572 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL4A2P08572 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL4A2P08572 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL4A2P08572 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL4A2P08572 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL4A2P08572 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
COL4A2P08572 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
COL4A2P08572 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
COL4A2P08572 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COL4A2P08572 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
COL4A2P08572 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
COL4A2P08572 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
COL4A2P08572 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COL4A2P08572 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COL4A2P08572 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL4A2P08572 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL4A2P08572 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL4A2P08572 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
COL4A2P08572 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
COL4A2P08572 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
COL4A2P08572 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
COL4A2P08572 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
COL4A2P08572 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
COL4A2P08572 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
COL4A2P08572 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
COL4A2P08572 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
COL4A2P08572 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
COL4A2P08572 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
COL4A2P08572 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
COL4A2P08572 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
COL4A2P08572 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
COL4A2P08572 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
COL4A2P08572 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
COL4A2P08572 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
COL4A2P08572 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
COL4A2P08572 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
COL4A2P08572 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
COL4A2P08572 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
COL4A2P08572 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
COL4A2P08572 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
COL4A2P08572 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
COL4A2P08572 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
COL4A2P08572 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
COL4A2P08572 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
COL4A2P08572 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
COL4A2P08572 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
COL4A2P08572 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
COL4A2P08572 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
COL4A2P08572 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
COL4A2P08572 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
COL4A2P08572 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
COL4A2P08572 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
COL4A2P08572 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
COL4A2P08572 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
COL4A2P08572 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
COL4A2P08572 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
COL4A2P08572 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
COL4A2P08572 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
COL4A2P08572 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
COL4A2P08572 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
COL4A2P08572 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
COL4A2P08572 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
COL4A2P08572 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
COL4A2P08572 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms