Protein–RNA interactions for Protein: P08174

CD55, Complement decay-accelerating factor, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD55P08174 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD55P08174 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD55P08174 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD55P08174 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD55P08174 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD55P08174 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD55P08174 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD55P08174 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CD55P08174 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD55P08174 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD55P08174 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD55P08174 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD55P08174 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD55P08174 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD55P08174 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD55P08174 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD55P08174 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD55P08174 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD55P08174 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD55P08174 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD55P08174 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CD55P08174 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD55P08174 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD55P08174 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD55P08174 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD55P08174 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD55P08174 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD55P08174 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD55P08174 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD55P08174 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD55P08174 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD55P08174 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD55P08174 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD55P08174 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD55P08174 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CD55P08174 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD55P08174 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CD55P08174 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD55P08174 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD55P08174 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD55P08174 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD55P08174 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD55P08174 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD55P08174 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD55P08174 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD55P08174 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CD55P08174 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CD55P08174 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD55P08174 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD55P08174 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD55P08174 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD55P08174 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD55P08174 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CD55P08174 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD55P08174 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD55P08174 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD55P08174 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CD55P08174 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD55P08174 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD55P08174 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD55P08174 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD55P08174 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD55P08174 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD55P08174 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD55P08174 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD55P08174 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD55P08174 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD55P08174 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD55P08174 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD55P08174 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD55P08174 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD55P08174 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD55P08174 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD55P08174 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD55P08174 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD55P08174 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD55P08174 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CD55P08174 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD55P08174 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD55P08174 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CD55P08174 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CD55P08174 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CD55P08174 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD55P08174 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD55P08174 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD55P08174 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD55P08174 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CD55P08174 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD55P08174 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD55P08174 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD55P08174 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD55P08174 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD55P08174 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD55P08174 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD55P08174 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD55P08174 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD55P08174 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD55P08174 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD55P08174 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD55P08174 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.6 ms