Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
CSF1RP07333 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CSF1RP07333 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CSF1RP07333 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CSF1RP07333 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CSF1RP07333 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CSF1RP07333 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CSF1RP07333 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CSF1RP07333 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CSF1RP07333 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CSF1RP07333 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CSF1RP07333 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CSF1RP07333 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CSF1RP07333 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CSF1RP07333 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CSF1RP07333 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CSF1RP07333 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CSF1RP07333 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CSF1RP07333 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CSF1RP07333 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC32.45■■■□□ 2.78
CSF1RP07333 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CSF1RP07333 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CSF1RP07333 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CSF1RP07333 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CSF1RP07333 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CSF1RP07333 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CSF1RP07333 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CSF1RP07333 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CSF1RP07333 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CSF1RP07333 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CSF1RP07333 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CSF1RP07333 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CSF1RP07333 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CSF1RP07333 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CSF1RP07333 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CSF1RP07333 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CSF1RP07333 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CSF1RP07333 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CSF1RP07333 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CSF1RP07333 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CSF1RP07333 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CSF1RP07333 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CSF1RP07333 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CSF1RP07333 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CSF1RP07333 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CSF1RP07333 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CSF1RP07333 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
CSF1RP07333 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CSF1RP07333 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CSF1RP07333 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CSF1RP07333 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CSF1RP07333 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CSF1RP07333 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CSF1RP07333 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CSF1RP07333 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CSF1RP07333 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CSF1RP07333 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
CSF1RP07333 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
CSF1RP07333 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CSF1RP07333 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
CSF1RP07333 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CSF1RP07333 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CSF1RP07333 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CSF1RP07333 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CSF1RP07333 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CSF1RP07333 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CSF1RP07333 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CSF1RP07333 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CSF1RP07333 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CSF1RP07333 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
CSF1RP07333 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CSF1RP07333 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CSF1RP07333 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CSF1RP07333 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CSF1RP07333 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CSF1RP07333 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CSF1RP07333 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CSF1RP07333 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CSF1RP07333 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CSF1RP07333 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CSF1RP07333 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CSF1RP07333 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CSF1RP07333 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CSF1RP07333 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CSF1RP07333 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CSF1RP07333 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CSF1RP07333 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CSF1RP07333 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CSF1RP07333 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CSF1RP07333 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CSF1RP07333 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
CSF1RP07333 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CSF1RP07333 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CSF1RP07333 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CSF1RP07333 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CSF1RP07333 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CSF1RP07333 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CSF1RP07333 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CSF1RP07333 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CSF1RP07333 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms