Protein–RNA interactions for Protein: P06746

POLB, DNA polymerase beta, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLBP06746 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLBP06746 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLBP06746 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLBP06746 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLBP06746 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLBP06746 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLBP06746 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLBP06746 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLBP06746 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
POLBP06746 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLBP06746 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLBP06746 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLBP06746 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLBP06746 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLBP06746 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLBP06746 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLBP06746 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLBP06746 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLBP06746 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLBP06746 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
POLBP06746 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
POLBP06746 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLBP06746 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLBP06746 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLBP06746 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLBP06746 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLBP06746 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLBP06746 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLBP06746 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
POLBP06746 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLBP06746 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLBP06746 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
POLBP06746 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
POLBP06746 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLBP06746 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
POLBP06746 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
POLBP06746 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLBP06746 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLBP06746 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLBP06746 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLBP06746 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLBP06746 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLBP06746 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
POLBP06746 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLBP06746 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLBP06746 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLBP06746 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLBP06746 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
POLBP06746 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLBP06746 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLBP06746 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLBP06746 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLBP06746 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLBP06746 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLBP06746 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLBP06746 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLBP06746 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLBP06746 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
POLBP06746 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLBP06746 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLBP06746 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLBP06746 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLBP06746 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLBP06746 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLBP06746 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLBP06746 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLBP06746 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLBP06746 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLBP06746 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLBP06746 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLBP06746 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLBP06746 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLBP06746 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLBP06746 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLBP06746 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLBP06746 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLBP06746 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLBP06746 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLBP06746 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
POLBP06746 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POLBP06746 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POLBP06746 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POLBP06746 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POLBP06746 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLBP06746 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLBP06746 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
POLBP06746 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLBP06746 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLBP06746 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLBP06746 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLBP06746 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLBP06746 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLBP06746 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLBP06746 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLBP06746 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLBP06746 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLBP06746 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLBP06746 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLBP06746 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLBP06746 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.1 ms