Protein–RNA interactions for Protein: P05813

CRYBA1, Beta-crystallin A3, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYBA1P05813 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRYBA1P05813 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRYBA1P05813 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRYBA1P05813 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRYBA1P05813 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRYBA1P05813 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRYBA1P05813 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRYBA1P05813 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRYBA1P05813 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRYBA1P05813 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRYBA1P05813 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRYBA1P05813 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRYBA1P05813 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRYBA1P05813 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRYBA1P05813 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRYBA1P05813 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRYBA1P05813 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRYBA1P05813 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRYBA1P05813 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRYBA1P05813 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRYBA1P05813 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRYBA1P05813 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRYBA1P05813 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRYBA1P05813 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRYBA1P05813 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRYBA1P05813 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRYBA1P05813 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRYBA1P05813 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRYBA1P05813 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRYBA1P05813 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRYBA1P05813 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRYBA1P05813 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRYBA1P05813 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRYBA1P05813 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRYBA1P05813 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRYBA1P05813 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRYBA1P05813 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRYBA1P05813 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRYBA1P05813 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRYBA1P05813 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRYBA1P05813 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRYBA1P05813 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CRYBA1P05813 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRYBA1P05813 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRYBA1P05813 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRYBA1P05813 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRYBA1P05813 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRYBA1P05813 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRYBA1P05813 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRYBA1P05813 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRYBA1P05813 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRYBA1P05813 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRYBA1P05813 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRYBA1P05813 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRYBA1P05813 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRYBA1P05813 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRYBA1P05813 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRYBA1P05813 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRYBA1P05813 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRYBA1P05813 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRYBA1P05813 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRYBA1P05813 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRYBA1P05813 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRYBA1P05813 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CRYBA1P05813 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRYBA1P05813 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRYBA1P05813 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CRYBA1P05813 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRYBA1P05813 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CRYBA1P05813 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRYBA1P05813 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CRYBA1P05813 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CRYBA1P05813 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRYBA1P05813 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CRYBA1P05813 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CRYBA1P05813 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CRYBA1P05813 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CRYBA1P05813 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CRYBA1P05813 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CRYBA1P05813 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CRYBA1P05813 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CRYBA1P05813 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CRYBA1P05813 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRYBA1P05813 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CRYBA1P05813 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRYBA1P05813 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRYBA1P05813 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRYBA1P05813 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRYBA1P05813 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRYBA1P05813 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRYBA1P05813 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CRYBA1P05813 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRYBA1P05813 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRYBA1P05813 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRYBA1P05813 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRYBA1P05813 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRYBA1P05813 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRYBA1P05813 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRYBA1P05813 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CRYBA1P05813 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms