Protein–RNA interactions for Protein: P05787

KRT8, Keratin, type II cytoskeletal 8, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT8P05787 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT8P05787 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT8P05787 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT8P05787 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT8P05787 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT8P05787 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT8P05787 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT8P05787 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT8P05787 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT8P05787 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT8P05787 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT8P05787 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT8P05787 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT8P05787 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT8P05787 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT8P05787 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT8P05787 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT8P05787 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT8P05787 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT8P05787 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT8P05787 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT8P05787 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT8P05787 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT8P05787 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT8P05787 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT8P05787 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT8P05787 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT8P05787 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT8P05787 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT8P05787 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT8P05787 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT8P05787 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT8P05787 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT8P05787 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT8P05787 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT8P05787 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT8P05787 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT8P05787 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT8P05787 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT8P05787 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT8P05787 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT8P05787 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT8P05787 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT8P05787 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT8P05787 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT8P05787 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT8P05787 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT8P05787 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT8P05787 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT8P05787 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT8P05787 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT8P05787 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT8P05787 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT8P05787 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT8P05787 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT8P05787 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT8P05787 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT8P05787 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT8P05787 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT8P05787 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT8P05787 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT8P05787 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT8P05787 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT8P05787 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT8P05787 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT8P05787 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT8P05787 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT8P05787 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT8P05787 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT8P05787 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT8P05787 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT8P05787 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT8P05787 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT8P05787 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT8P05787 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT8P05787 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT8P05787 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT8P05787 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT8P05787 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT8P05787 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT8P05787 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT8P05787 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT8P05787 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT8P05787 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT8P05787 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT8P05787 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT8P05787 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT8P05787 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT8P05787 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT8P05787 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT8P05787 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT8P05787 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT8P05787 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT8P05787 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT8P05787 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT8P05787 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT8P05787 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT8P05787 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT8P05787 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT8P05787 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms