Protein–RNA interactions for Protein: P04435

TCRB, T-cell receptor beta chain V region CTL-L17, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBP04435 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCRBP04435 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCRBP04435 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCRBP04435 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCRBP04435 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCRBP04435 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCRBP04435 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCRBP04435 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCRBP04435 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCRBP04435 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCRBP04435 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCRBP04435 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCRBP04435 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCRBP04435 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCRBP04435 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCRBP04435 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCRBP04435 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCRBP04435 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCRBP04435 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCRBP04435 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCRBP04435 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCRBP04435 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCRBP04435 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCRBP04435 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCRBP04435 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TCRBP04435 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCRBP04435 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCRBP04435 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCRBP04435 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCRBP04435 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCRBP04435 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCRBP04435 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCRBP04435 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCRBP04435 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCRBP04435 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCRBP04435 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCRBP04435 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCRBP04435 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCRBP04435 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCRBP04435 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCRBP04435 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCRBP04435 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCRBP04435 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCRBP04435 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCRBP04435 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCRBP04435 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCRBP04435 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCRBP04435 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCRBP04435 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCRBP04435 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TCRBP04435 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCRBP04435 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCRBP04435 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCRBP04435 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TCRBP04435 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TCRBP04435 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TCRBP04435 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCRBP04435 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCRBP04435 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCRBP04435 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCRBP04435 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCRBP04435 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCRBP04435 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCRBP04435 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCRBP04435 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCRBP04435 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCRBP04435 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCRBP04435 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCRBP04435 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCRBP04435 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCRBP04435 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCRBP04435 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCRBP04435 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCRBP04435 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCRBP04435 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCRBP04435 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCRBP04435 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCRBP04435 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCRBP04435 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCRBP04435 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCRBP04435 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCRBP04435 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TCRBP04435 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCRBP04435 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCRBP04435 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCRBP04435 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCRBP04435 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCRBP04435 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCRBP04435 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCRBP04435 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCRBP04435 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCRBP04435 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TCRBP04435 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TCRBP04435 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TCRBP04435 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCRBP04435 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCRBP04435 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCRBP04435 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCRBP04435 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCRBP04435 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms