Protein–RNA interactions for Protein: P03905

MT-ND4, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-ND4P03905 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MT-ND4P03905 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MT-ND4P03905 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MT-ND4P03905 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MT-ND4P03905 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MT-ND4P03905 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MT-ND4P03905 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MT-ND4P03905 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MT-ND4P03905 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MT-ND4P03905 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MT-ND4P03905 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MT-ND4P03905 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MT-ND4P03905 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MT-ND4P03905 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MT-ND4P03905 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MT-ND4P03905 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MT-ND4P03905 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MT-ND4P03905 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MT-ND4P03905 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MT-ND4P03905 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MT-ND4P03905 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MT-ND4P03905 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MT-ND4P03905 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MT-ND4P03905 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MT-ND4P03905 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MT-ND4P03905 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MT-ND4P03905 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MT-ND4P03905 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MT-ND4P03905 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MT-ND4P03905 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MT-ND4P03905 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MT-ND4P03905 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MT-ND4P03905 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MT-ND4P03905 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MT-ND4P03905 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MT-ND4P03905 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MT-ND4P03905 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MT-ND4P03905 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MT-ND4P03905 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MT-ND4P03905 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MT-ND4P03905 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MT-ND4P03905 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MT-ND4P03905 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MT-ND4P03905 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MT-ND4P03905 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MT-ND4P03905 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MT-ND4P03905 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MT-ND4P03905 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MT-ND4P03905 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MT-ND4P03905 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MT-ND4P03905 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MT-ND4P03905 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MT-ND4P03905 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MT-ND4P03905 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MT-ND4P03905 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MT-ND4P03905 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MT-ND4P03905 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MT-ND4P03905 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MT-ND4P03905 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MT-ND4P03905 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MT-ND4P03905 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MT-ND4P03905 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MT-ND4P03905 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MT-ND4P03905 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MT-ND4P03905 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MT-ND4P03905 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MT-ND4P03905 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MT-ND4P03905 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MT-ND4P03905 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MT-ND4P03905 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MT-ND4P03905 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MT-ND4P03905 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MT-ND4P03905 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MT-ND4P03905 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MT-ND4P03905 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MT-ND4P03905 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MT-ND4P03905 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MT-ND4P03905 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MT-ND4P03905 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MT-ND4P03905 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MT-ND4P03905 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MT-ND4P03905 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MT-ND4P03905 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MT-ND4P03905 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MT-ND4P03905 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MT-ND4P03905 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MT-ND4P03905 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MT-ND4P03905 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MT-ND4P03905 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MT-ND4P03905 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MT-ND4P03905 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MT-ND4P03905 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MT-ND4P03905 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MT-ND4P03905 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MT-ND4P03905 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MT-ND4P03905 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MT-ND4P03905 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MT-ND4P03905 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MT-ND4P03905 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MT-ND4P03905 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms