Protein–RNA interactions for Protein: P01594

IGKV1-33, Immunoglobulin kappa variable 1-33, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-33P01594 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IGKV1-33P01594 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IGKV1-33P01594 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IGKV1-33P01594 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IGKV1-33P01594 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IGKV1-33P01594 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IGKV1-33P01594 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IGKV1-33P01594 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IGKV1-33P01594 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IGKV1-33P01594 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IGKV1-33P01594 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IGKV1-33P01594 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IGKV1-33P01594 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
IGKV1-33P01594 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IGKV1-33P01594 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IGKV1-33P01594 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IGKV1-33P01594 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IGKV1-33P01594 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
IGKV1-33P01594 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IGKV1-33P01594 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IGKV1-33P01594 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
IGKV1-33P01594 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IGKV1-33P01594 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGKV1-33P01594 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGKV1-33P01594 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGKV1-33P01594 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGKV1-33P01594 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGKV1-33P01594 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGKV1-33P01594 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGKV1-33P01594 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IGKV1-33P01594 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IGKV1-33P01594 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IGKV1-33P01594 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IGKV1-33P01594 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IGKV1-33P01594 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IGKV1-33P01594 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IGKV1-33P01594 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
IGKV1-33P01594 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
IGKV1-33P01594 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IGKV1-33P01594 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IGKV1-33P01594 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
IGKV1-33P01594 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
IGKV1-33P01594 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
IGKV1-33P01594 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IGKV1-33P01594 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IGKV1-33P01594 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IGKV1-33P01594 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IGKV1-33P01594 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IGKV1-33P01594 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IGKV1-33P01594 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IGKV1-33P01594 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IGKV1-33P01594 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IGKV1-33P01594 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IGKV1-33P01594 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IGKV1-33P01594 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
IGKV1-33P01594 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IGKV1-33P01594 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IGKV1-33P01594 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IGKV1-33P01594 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IGKV1-33P01594 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IGKV1-33P01594 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IGKV1-33P01594 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IGKV1-33P01594 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IGKV1-33P01594 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IGKV1-33P01594 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IGKV1-33P01594 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IGKV1-33P01594 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IGKV1-33P01594 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IGKV1-33P01594 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IGKV1-33P01594 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IGKV1-33P01594 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IGKV1-33P01594 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IGKV1-33P01594 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IGKV1-33P01594 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IGKV1-33P01594 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21■□□□□ 0.95
IGKV1-33P01594 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IGKV1-33P01594 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IGKV1-33P01594 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IGKV1-33P01594 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
IGKV1-33P01594 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IGKV1-33P01594 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IGKV1-33P01594 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IGKV1-33P01594 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IGKV1-33P01594 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IGKV1-33P01594 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IGKV1-33P01594 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IGKV1-33P01594 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IGKV1-33P01594 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IGKV1-33P01594 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IGKV1-33P01594 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IGKV1-33P01594 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
IGKV1-33P01594 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IGKV1-33P01594 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IGKV1-33P01594 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IGKV1-33P01594 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IGKV1-33P01594 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IGKV1-33P01594 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IGKV1-33P01594 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IGKV1-33P01594 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IGKV1-33P01594 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms