Protein–RNA interactions for Protein: P01034

CST3, Cystatin-C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST3P01034 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CST3P01034 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CST3P01034 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CST3P01034 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CST3P01034 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CST3P01034 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CST3P01034 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CST3P01034 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CST3P01034 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CST3P01034 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CST3P01034 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CST3P01034 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CST3P01034 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CST3P01034 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CST3P01034 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CST3P01034 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CST3P01034 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CST3P01034 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CST3P01034 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CST3P01034 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CST3P01034 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CST3P01034 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CST3P01034 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CST3P01034 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CST3P01034 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CST3P01034 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CST3P01034 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CST3P01034 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CST3P01034 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CST3P01034 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CST3P01034 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CST3P01034 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CST3P01034 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
CST3P01034 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CST3P01034 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CST3P01034 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CST3P01034 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CST3P01034 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CST3P01034 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CST3P01034 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CST3P01034 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CST3P01034 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CST3P01034 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CST3P01034 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CST3P01034 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CST3P01034 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CST3P01034 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CST3P01034 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CST3P01034 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CST3P01034 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CST3P01034 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CST3P01034 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CST3P01034 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CST3P01034 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CST3P01034 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CST3P01034 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CST3P01034 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CST3P01034 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CST3P01034 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CST3P01034 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CST3P01034 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CST3P01034 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CST3P01034 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CST3P01034 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CST3P01034 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CST3P01034 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CST3P01034 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CST3P01034 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CST3P01034 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CST3P01034 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CST3P01034 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CST3P01034 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CST3P01034 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CST3P01034 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CST3P01034 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CST3P01034 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CST3P01034 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CST3P01034 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CST3P01034 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CST3P01034 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CST3P01034 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CST3P01034 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CST3P01034 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CST3P01034 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CST3P01034 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CST3P01034 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CST3P01034 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CST3P01034 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CST3P01034 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CST3P01034 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CST3P01034 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CST3P01034 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CST3P01034 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CST3P01034 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CST3P01034 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CST3P01034 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CST3P01034 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CST3P01034 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CST3P01034 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CST3P01034 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms