Protein–RNA interactions for Protein: O95758

PTBP3, Polypyrimidine tract-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTBP3O95758 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTBP3O95758 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTBP3O95758 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTBP3O95758 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTBP3O95758 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTBP3O95758 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTBP3O95758 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTBP3O95758 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTBP3O95758 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTBP3O95758 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTBP3O95758 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTBP3O95758 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTBP3O95758 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTBP3O95758 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTBP3O95758 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTBP3O95758 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTBP3O95758 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTBP3O95758 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PTBP3O95758 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTBP3O95758 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTBP3O95758 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTBP3O95758 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTBP3O95758 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTBP3O95758 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTBP3O95758 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTBP3O95758 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTBP3O95758 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTBP3O95758 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTBP3O95758 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTBP3O95758 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTBP3O95758 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTBP3O95758 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTBP3O95758 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTBP3O95758 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTBP3O95758 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTBP3O95758 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTBP3O95758 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTBP3O95758 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTBP3O95758 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PTBP3O95758 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTBP3O95758 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTBP3O95758 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTBP3O95758 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PTBP3O95758 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTBP3O95758 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTBP3O95758 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTBP3O95758 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTBP3O95758 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTBP3O95758 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTBP3O95758 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTBP3O95758 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTBP3O95758 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTBP3O95758 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTBP3O95758 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTBP3O95758 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTBP3O95758 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTBP3O95758 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTBP3O95758 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTBP3O95758 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTBP3O95758 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PTBP3O95758 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTBP3O95758 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTBP3O95758 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTBP3O95758 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTBP3O95758 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTBP3O95758 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTBP3O95758 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PTBP3O95758 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PTBP3O95758 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTBP3O95758 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTBP3O95758 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTBP3O95758 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTBP3O95758 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTBP3O95758 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTBP3O95758 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTBP3O95758 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTBP3O95758 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTBP3O95758 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTBP3O95758 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTBP3O95758 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTBP3O95758 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTBP3O95758 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTBP3O95758 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTBP3O95758 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTBP3O95758 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTBP3O95758 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PTBP3O95758 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTBP3O95758 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTBP3O95758 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTBP3O95758 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTBP3O95758 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTBP3O95758 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTBP3O95758 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTBP3O95758 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTBP3O95758 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTBP3O95758 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTBP3O95758 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTBP3O95758 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTBP3O95758 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTBP3O95758 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms