Protein–RNA interactions for Protein: O95264

HTR3B, 5-hydroxytryptamine receptor 3B, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR3BO95264 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTR3BO95264 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTR3BO95264 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTR3BO95264 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTR3BO95264 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTR3BO95264 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTR3BO95264 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HTR3BO95264 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTR3BO95264 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTR3BO95264 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HTR3BO95264 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HTR3BO95264 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HTR3BO95264 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HTR3BO95264 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HTR3BO95264 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HTR3BO95264 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HTR3BO95264 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HTR3BO95264 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HTR3BO95264 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HTR3BO95264 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HTR3BO95264 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTR3BO95264 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTR3BO95264 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTR3BO95264 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTR3BO95264 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTR3BO95264 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HTR3BO95264 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTR3BO95264 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTR3BO95264 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTR3BO95264 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTR3BO95264 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTR3BO95264 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTR3BO95264 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTR3BO95264 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTR3BO95264 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HTR3BO95264 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HTR3BO95264 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTR3BO95264 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTR3BO95264 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTR3BO95264 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTR3BO95264 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTR3BO95264 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTR3BO95264 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTR3BO95264 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTR3BO95264 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTR3BO95264 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR3BO95264 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR3BO95264 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR3BO95264 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR3BO95264 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR3BO95264 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTR3BO95264 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTR3BO95264 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTR3BO95264 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HTR3BO95264 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HTR3BO95264 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTR3BO95264 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTR3BO95264 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HTR3BO95264 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HTR3BO95264 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HTR3BO95264 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR3BO95264 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR3BO95264 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR3BO95264 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR3BO95264 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR3BO95264 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR3BO95264 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HTR3BO95264 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTR3BO95264 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTR3BO95264 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTR3BO95264 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTR3BO95264 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTR3BO95264 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HTR3BO95264 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HTR3BO95264 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HTR3BO95264 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTR3BO95264 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
HTR3BO95264 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
HTR3BO95264 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HTR3BO95264 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HTR3BO95264 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HTR3BO95264 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HTR3BO95264 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HTR3BO95264 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HTR3BO95264 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HTR3BO95264 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HTR3BO95264 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HTR3BO95264 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HTR3BO95264 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HTR3BO95264 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HTR3BO95264 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HTR3BO95264 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HTR3BO95264 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HTR3BO95264 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HTR3BO95264 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HTR3BO95264 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HTR3BO95264 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HTR3BO95264 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HTR3BO95264 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HTR3BO95264 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms