Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GCATO75600 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GCATO75600 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GCATO75600 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GCATO75600 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GCATO75600 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GCATO75600 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GCATO75600 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GCATO75600 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GCATO75600 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GCATO75600 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GCATO75600 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GCATO75600 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GCATO75600 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GCATO75600 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GCATO75600 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GCATO75600 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GCATO75600 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
GCATO75600 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GCATO75600 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GCATO75600 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GCATO75600 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GCATO75600 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GCATO75600 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GCATO75600 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GCATO75600 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GCATO75600 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GCATO75600 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GCATO75600 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GCATO75600 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
GCATO75600 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GCATO75600 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GCATO75600 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GCATO75600 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GCATO75600 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
GCATO75600 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GCATO75600 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GCATO75600 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GCATO75600 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GCATO75600 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
GCATO75600 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GCATO75600 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GCATO75600 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GCATO75600 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GCATO75600 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GCATO75600 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
GCATO75600 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GCATO75600 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GCATO75600 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GCATO75600 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GCATO75600 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
GCATO75600 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GCATO75600 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GCATO75600 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GCATO75600 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GCATO75600 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GCATO75600 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GCATO75600 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GCATO75600 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GCATO75600 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GCATO75600 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GCATO75600 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GCATO75600 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GCATO75600 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GCATO75600 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
GCATO75600 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GCATO75600 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GCATO75600 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GCATO75600 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GCATO75600 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GCATO75600 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GCATO75600 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GCATO75600 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GCATO75600 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GCATO75600 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GCATO75600 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GCATO75600 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GCATO75600 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GCATO75600 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GCATO75600 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GCATO75600 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GCATO75600 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GCATO75600 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GCATO75600 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GCATO75600 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GCATO75600 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GCATO75600 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GCATO75600 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GCATO75600 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GCATO75600 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GCATO75600 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GCATO75600 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GCATO75600 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GCATO75600 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GCATO75600 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GCATO75600 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GCATO75600 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GCATO75600 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GCATO75600 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GCATO75600 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms