Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PPFIA4O75335 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PPFIA4O75335 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PPFIA4O75335 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PPFIA4O75335 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PPFIA4O75335 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PPFIA4O75335 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PPFIA4O75335 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PPFIA4O75335 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PPFIA4O75335 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PPFIA4O75335 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PPFIA4O75335 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PPFIA4O75335 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PPFIA4O75335 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PPFIA4O75335 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PPFIA4O75335 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PPFIA4O75335 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PPFIA4O75335 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PPFIA4O75335 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PPFIA4O75335 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PPFIA4O75335 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PPFIA4O75335 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PPFIA4O75335 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PPFIA4O75335 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PPFIA4O75335 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PPFIA4O75335 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PPFIA4O75335 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PPFIA4O75335 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PPFIA4O75335 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PPFIA4O75335 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PPFIA4O75335 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PPFIA4O75335 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PPFIA4O75335 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PPFIA4O75335 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PPFIA4O75335 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PPFIA4O75335 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PPFIA4O75335 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PPFIA4O75335 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PPFIA4O75335 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PPFIA4O75335 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PPFIA4O75335 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PPFIA4O75335 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
PPFIA4O75335 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PPFIA4O75335 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PPFIA4O75335 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PPFIA4O75335 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PPFIA4O75335 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PPFIA4O75335 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PPFIA4O75335 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PPFIA4O75335 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PPFIA4O75335 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PPFIA4O75335 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PPFIA4O75335 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PPFIA4O75335 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PPFIA4O75335 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PPFIA4O75335 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PPFIA4O75335 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PPFIA4O75335 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PPFIA4O75335 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PPFIA4O75335 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PPFIA4O75335 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PPFIA4O75335 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PPFIA4O75335 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PPFIA4O75335 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PPFIA4O75335 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PPFIA4O75335 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PPFIA4O75335 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PPFIA4O75335 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
PPFIA4O75335 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
PPFIA4O75335 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PPFIA4O75335 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PPFIA4O75335 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PPFIA4O75335 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PPFIA4O75335 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PPFIA4O75335 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PPFIA4O75335 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PPFIA4O75335 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PPFIA4O75335 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PPFIA4O75335 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
PPFIA4O75335 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PPFIA4O75335 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PPFIA4O75335 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PPFIA4O75335 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PPFIA4O75335 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PPFIA4O75335 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PPFIA4O75335 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PPFIA4O75335 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PPFIA4O75335 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PPFIA4O75335 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
PPFIA4O75335 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPFIA4O75335 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PPFIA4O75335 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PPFIA4O75335 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PPFIA4O75335 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PPFIA4O75335 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PPFIA4O75335 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PPFIA4O75335 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PPFIA4O75335 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PPFIA4O75335 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PPFIA4O75335 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms