Protein–RNA interactions for Protein: O75200

NPIPB7, Nuclear pore complex-interacting protein family member B7, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB7O75200 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPIPB7O75200 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPIPB7O75200 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPIPB7O75200 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPIPB7O75200 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPIPB7O75200 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NPIPB7O75200 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NPIPB7O75200 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NPIPB7O75200 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPIPB7O75200 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPIPB7O75200 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPIPB7O75200 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPIPB7O75200 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NPIPB7O75200 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NPIPB7O75200 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPIPB7O75200 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPIPB7O75200 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NPIPB7O75200 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPIPB7O75200 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPIPB7O75200 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPIPB7O75200 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NPIPB7O75200 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPIPB7O75200 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPIPB7O75200 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPIPB7O75200 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPIPB7O75200 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPIPB7O75200 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPIPB7O75200 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPIPB7O75200 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPIPB7O75200 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPIPB7O75200 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPIPB7O75200 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPIPB7O75200 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPIPB7O75200 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPIPB7O75200 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPIPB7O75200 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPIPB7O75200 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPIPB7O75200 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPIPB7O75200 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPIPB7O75200 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NPIPB7O75200 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPIPB7O75200 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPIPB7O75200 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPIPB7O75200 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPIPB7O75200 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPIPB7O75200 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPIPB7O75200 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPIPB7O75200 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPIPB7O75200 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NPIPB7O75200 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPIPB7O75200 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPIPB7O75200 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPIPB7O75200 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPIPB7O75200 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPIPB7O75200 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPIPB7O75200 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPIPB7O75200 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPIPB7O75200 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPIPB7O75200 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPIPB7O75200 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPIPB7O75200 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPIPB7O75200 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NPIPB7O75200 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NPIPB7O75200 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NPIPB7O75200 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NPIPB7O75200 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NPIPB7O75200 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NPIPB7O75200 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NPIPB7O75200 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPIPB7O75200 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPIPB7O75200 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPIPB7O75200 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPIPB7O75200 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPIPB7O75200 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPIPB7O75200 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPIPB7O75200 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPIPB7O75200 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPIPB7O75200 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPIPB7O75200 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPIPB7O75200 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NPIPB7O75200 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPIPB7O75200 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NPIPB7O75200 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPIPB7O75200 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NPIPB7O75200 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NPIPB7O75200 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NPIPB7O75200 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NPIPB7O75200 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NPIPB7O75200 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NPIPB7O75200 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NPIPB7O75200 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NPIPB7O75200 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NPIPB7O75200 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NPIPB7O75200 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NPIPB7O75200 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NPIPB7O75200 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NPIPB7O75200 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NPIPB7O75200 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NPIPB7O75200 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NPIPB7O75200 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms