Protein–RNA interactions for Protein: O60361

NME2P1, Putative nucleoside diphosphate kinase, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME2P1O60361 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NME2P1O60361 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NME2P1O60361 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NME2P1O60361 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NME2P1O60361 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NME2P1O60361 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NME2P1O60361 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NME2P1O60361 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NME2P1O60361 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NME2P1O60361 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NME2P1O60361 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NME2P1O60361 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NME2P1O60361 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NME2P1O60361 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NME2P1O60361 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NME2P1O60361 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NME2P1O60361 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NME2P1O60361 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NME2P1O60361 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NME2P1O60361 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NME2P1O60361 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NME2P1O60361 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NME2P1O60361 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NME2P1O60361 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NME2P1O60361 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NME2P1O60361 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NME2P1O60361 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NME2P1O60361 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NME2P1O60361 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NME2P1O60361 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NME2P1O60361 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NME2P1O60361 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NME2P1O60361 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NME2P1O60361 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NME2P1O60361 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NME2P1O60361 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NME2P1O60361 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NME2P1O60361 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NME2P1O60361 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NME2P1O60361 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NME2P1O60361 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NME2P1O60361 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NME2P1O60361 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NME2P1O60361 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NME2P1O60361 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NME2P1O60361 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NME2P1O60361 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NME2P1O60361 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NME2P1O60361 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NME2P1O60361 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NME2P1O60361 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NME2P1O60361 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NME2P1O60361 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NME2P1O60361 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NME2P1O60361 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NME2P1O60361 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NME2P1O60361 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NME2P1O60361 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NME2P1O60361 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NME2P1O60361 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NME2P1O60361 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NME2P1O60361 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NME2P1O60361 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NME2P1O60361 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NME2P1O60361 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NME2P1O60361 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NME2P1O60361 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NME2P1O60361 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NME2P1O60361 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NME2P1O60361 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NME2P1O60361 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NME2P1O60361 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NME2P1O60361 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NME2P1O60361 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NME2P1O60361 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NME2P1O60361 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NME2P1O60361 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NME2P1O60361 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NME2P1O60361 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NME2P1O60361 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NME2P1O60361 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NME2P1O60361 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NME2P1O60361 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NME2P1O60361 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NME2P1O60361 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NME2P1O60361 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NME2P1O60361 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NME2P1O60361 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NME2P1O60361 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NME2P1O60361 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NME2P1O60361 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NME2P1O60361 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NME2P1O60361 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NME2P1O60361 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NME2P1O60361 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NME2P1O60361 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NME2P1O60361 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NME2P1O60361 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NME2P1O60361 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NME2P1O60361 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.3 ms